Die Genomik des steroidresistenten nephrotischen Syndroms und rezidivierender Formen
Humangenetik
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Die genaue Aufklärung der genetischen Basis von isolierten oder komplexen (Erkrankungen die nicht ausschließlich die Niere, sondern auch weitere Organsysteme betreffen Nierenerkrankungen ist für einen nicht unwesentlichen Anteil von pädiatrischen Patienten aber für einen relevanten Anteil an erwachsenen Patienten bereits heute möglich. Neue Verfahren der DNA-Analyse wie die sog. longread Sequenzierverfahren die mitunter Leselängen von mehreren zehntausend DNA-Basen an einem Stück erlauben, machen eine Besserung Erfassung struktureller krankheitsrelevanter DNA-Veränderungen möglich und erhöhen so weiter die Rate an erfassbaren genetischen Erkrankungen. Die definierte molekulare Diagnosestellung kann bereits jetzt zur besseren (symptomatischen) Behandlung der Nierenerkrankung beigetragen und mitunter lebenslang vor Notwendigkeit einer Dialysetherapie bewahren. Außerdem ist so die Erfassung und ggf. rechtzeitige Behandlung weiterer Familienmitglieder mittels genetischer Untersuchungen schnell und effizient möglich, dies ist insbesondere in der Kinderheilkunde bei frühmanifesten schweren Nierenfunktionsstörung und Option der Lebendspende durch ein Elternteil aber auch in vielen Konstellationen im Bereich der Erwachsenen-Nephrologie von großer Bedeutung. Genomische Methoden lassen sich aber nicht nur sinnvoll für die Diagnose von Erkrankungen einsetzen, die Abgabe von zellfreier DNA in den Blutstrom (und andere Körperflüssigkeiten wie Urin) erlaubt auch die Nutzung von DNA als Biomarker für Nierenerkrankungen. Patienten die ein bestimmtes Muster an zellfreier DNA aus Nierengewebe im Blutstrom mit hohem Risiko für eine akute Nierenschädigung aufweisen, könnten so in Zukunft durch eine simple Blutabnahme kontinuierlich überwacht direkt erfasst und möglichst vorbeugend behandelt werden. Erkenntnisse und Erfahrungen die wir aus der Ursachenabklärung, Identifikation und Behandlung (seltener) genetischer Nierenerkrankungen gewinnen erlauben in Zukunft nicht nur eine gezielter Behandlung dieser Erkrankungen, sondern lassen auch auf andere, häufigere Formen chronischer Nierenerkrankungen übertragen und können so einer deutlich größeren Gruppe an Patienten zugutekommen.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
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A molecular mechanism explaining albuminuria in kidney disease. Nature Metabolism, 2(5), 461-474.
Butt, Linus; Unnersjö-Jess, David; Höhne, Martin; Edwards, Aurelie; Binz-Lotter, Julia; Reilly, Dervla; Hahnfeldt, Robert; Ziegler, Vera; Fremter, Katharina; Rinschen, Markus M.; Helmstädter, Martin; Ebert, Lena K.; Castrop, Hayo; Hackl, Matthias J.; Walz, Gerd; Brinkkoetter, Paul T.; Liebau, Max C.; Tory, Kálmán; Hoyer, Peter F. ... & Benzing, Thomas
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cfNOMe —A single assay for comprehensive epigenetic analyses of cell-free DNA. Genome Medicine, 12(1).
Erger, Florian; Nörling, Deborah; Borchert, Domenica; Leenen, Esther; Habbig, Sandra; Wiesener, Michael S.; Bartram, Malte P.; Wenzel, Andrea; Becker, Christian; Toliat, Mohammad R.; Nürnberg, Peter; Beck, Bodo B. & Altmüller, Janine
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De novo TRIM8 variants impair its protein localization to nuclear bodies and cause developmental delay, epilepsy, and focal segmental glomerulosclerosis. The American Journal of Human Genetics, 108(2), 357-367.
Weng, Patricia L.; Majmundar, Amar J.; Khan, Kamal; Lim, Tze Y.; Shril, Shirlee; Jin, Gina; Musgrove, John; Wang, Minxian; Ahram, Dina F.; Aggarwal, Vimla S.; Bier, Louise E.; Heinzen, Erin L.; Onuchic-Whitford, Ana C.; Mann, Nina; Buerger, Florian; Schneider, Ronen; Deutsch, Konstantin; Kitzler, Thomas M.; Klämbt, Verena ... & Sanna-Cherchi, Simone
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Expanding the Spectrum of FAT1 Nephropathies by Novel Mutations That Affect Hippo Signaling. Kidney International Reports, 6(5), 1368-1378.
Fabretti, Francesca; Tschernoster, Nikolai; Erger, Florian; Hedergott, Andrea; Buescher, Anja K.; Dafinger, Claudia; Reusch, Bjoern; Köntges, Vincent K.; Kohl, Stefan; Bartram, Malte P.; Weber, Lutz Thorsten; Thiele, Holger; Altmueller, Janine; Schermer, Bernhard; Beck, Bodo B. & Habbig, Sandra
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Alport syndrome and autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease frequently underlie end-stage renal disease of unknown origin—a single-center analysis. Nephrology Dialysis Transplantation, 37(10), 1895-1905.
Leenen, Esther; Erger, Florian; Altmüller, Janine; Wenzel, Andrea; Thiele, Holger; Harth, Ana; Tschernoster, Nikolai; Lokhande, Shanti; Joerres, Achim; Becker, Jan-Ulrich; Ekici, Arif; Huettel, Bruno; Beck, Bodo & Weidemann, Alexander
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Lifelong effect of therapy in young patients with the COL4A5 Alport missense variant p.(Gly624Asp): a prospective cohort study. Nephrology Dialysis Transplantation, 37(12), 2496-2504.
Boeckhaus, Jan; Hoefele, Julia; Riedhammer, Korbinian M.; Nagel, Mato; Beck, Bodo B.; Choi, Mira; Gollasch, Maik; Bergmann, Carsten; Sonntag, Joseph E.; Troesch, Victoria; Stock, Johanna & Gross, Oliver
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Unraveling Structural Rearrangements of the CFH Gene Cluster in Atypical Hemolytic Uremic Syndrome Patients Using Molecular Combing and Long-Fragment Targeted Sequencing. The Journal of Molecular Diagnostics, 24(6), 619-631.
Tschernoster, Nikolai; Erger, Florian; Walsh, Patrick R.; McNicholas, Bairbre; Fistrek, Margareta; Habbig, Sandra; Schumacher, Anna-Lena; Folz-Donahue, Kat; Kukat, Christian; Toliat, Mohammad R.; Becker, Christian; Thiele, Holger; Kavanagh, David; Nürnberg, Peter; Beck, Bodo B. & Altmüller, Janine
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Germline C1GALT1C1 mutation causes a multisystem chaperonopathy. Proceedings of the National Academy of Sciences, 120(22).
Erger, Florian; Aryal, Rajindra P.; Reusch, Björn; Matsumoto, Yasuyuki; Meyer, Robert; Zeng, Junwei; Knopp, Cordula; Noel, Maxence; Muerner, Lukas; Wenzel, Andrea; Kohl, Stefan; Tschernoster, Nikolai; Rappl, Gunter; Rouvet, Isabelle; Schröder-Braunstein, Jutta; Seibert, Felix S.; Thiele, Holger; Häusler, Martin G.; Weber, Lutz T. ... & Beck, Bodo B.
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Long-read sequencing identifies a common transposition haplotype predisposing for CLCNKB deletions. Genome Medicine, 15(1).
Tschernoster, Nikolai; Erger, Florian; Kohl, Stefan; Reusch, Björn; Wenzel, Andrea; Walsh, Stephen; Thiele, Holger; Becker, Christian; Franitza, Marek; Bartram, Malte P.; Kömhoff, Martin; Schumacher, Lena; Kukat, Christian; Borodina, Tatiana; Quedenau, Claudia; Nürnberg, Peter; Rinschen, Markus M.; Driller, Jan H.; Pedersen, Bjørn P. ... & Altmüller, Janine
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Modeling of ACTN4-Based Podocytopathy Using Drosophila Nephrocytes. Kidney International Reports, 8(2), 317-329.
Odenthal, Johanna; Dittrich, Sebastian; Ludwig, Vivian; Merz, Tim; Reitmeier, Katrin; Reusch, Björn; Höhne, Martin; Cosgun, Zülfü C.; Hohenadel, Maximilian; Putnik, Jovana; Göbel, Heike; Rinschen, Markus M.; Altmüller, Janine; Koehler, Sybille; Schermer, Bernhard; Benzing, Thomas; Beck, Bodo B.; Brinkkötter, Paul T.; Habbig, Sandra & Bartram, Malte P.
