Biomedical Informatics Support Platform (BISP) - bietet IT-Strukturen und -Pipelines zum Speichern, Austauschen und Integrieren der phänotypischen, genomischen und funktionalen Daten, die in SP1-7 und CP1 generiert wurden.

• Antragstellerinnen / Antragsteller: Professor Dr. Tim Beißbarth; Dr. Gabriela Salinas; Professor Dr. Ulrich Sax
• Fachliche Zuordnung: Gastroenterologie ; Epidemiologie und Medizinische Biometrie/Statistik
• Förderung: Förderung seit 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 426671079

Im Rahmen der KFO 5002 ist die Biomedical Informatics Support Platform (BISP) von CP2 für die Bereitstellung von IT-Strukturen und -Pipelines verantwortlich, um die zahlreichen in SP1-7 und CP1 generierten phänotypischen, genomischen und funktionalen Daten zu speichern, auszutauschen und zu integrieren und mit den umfassenden klinischen Anmerkungen, die im MolPAC-Programm gesammelt wurden, zusammenzuführen . Darüber hinaus wird dieses Kernprojekt Next-Generation-Sequencing-Studien für alle im Konsortium erforderlichen Genomanalysen begleiten und eine Transkriptomanalyse der in CP1 erstellten translationalen PDAC-Modelle durchführen. Darüber hinaus bietet CP2 allen wissenschaftlichen Teilprojekten eine statistische Beratung zur aussagekräftigen Planung und Durchführung ihrer genomischen Experimente an. Darüber hinaus ist CP2 für die Durchführung umfassender bioinformatischer Analysen und die qualifizierte Interpretation genomischer Daten verantwortlich. Schließlich wird CP2 die in der KFO 5002 gesammelten molekularen Subtypdaten mit den veröffentlichten Daten zu PDAC-Untergruppen integrieren und CP1 beim Vergleich von PDAC-PDX-Modellen und Organoiden auf ihre Subtypkonsistenz unterstützen.

• DFG-Verfahren: Klinische Forschungsgruppen
• Teilprojekt zu: KFO 5002: Charakterisierung und Targeting der Genomdynamik für eine Subtyp-spezifische Therapie des Pankreaskarzinoms