Dynamik von RNA-Modifikationen und -Prozessierung im Replikationszyklus von Flaviviren (A05)

• Fachliche Zuordnung: Virologie
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 439669440

Projekt A05 befasst sich mit der Entwicklung von Aufreinigungsmethoden zur Untersuchung von RNA-Modifikationen im Genom (gRNA) des Dengue-Virus (DENV) während des Viruslebenszyklus und deren Bedeutung. In FP1 haben wir eine einzige m5C-Stelle in der DENV-gRNA identifiziert und ihre Rolle im gRNA-Abbau entdeckt. In FP2 werden wir die Regulation dieser Modifikation analysieren, einschließlich potenzieller Reader- und Eraser-Proteine, und die Konservierung in anderen DENV-Serotypen untersuchen. Ein weiteres Ziel ist die Entwicklung einer In-Gel-Hybridisierungstechnik zur Isolierung ausreichender Mengen kurzer DENV-subgenomischer sfRNA für die Modifikationsanalyse mit LC-MS.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 319: RMaP: RNA Modifikation und Prozessierung
• Antragstellende Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professor Dr. Mark Helm; Alessia Ruggieri, Ph.D.