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SFB 1557: Funktionelle Plastizität, kodiert durch zellulare Membrannetzwerke
Fachliche Zuordnung
Biologie
Förderung
Förderung seit 2023
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 467522186
Das Leben hängt von der Fähigkeit ab, sich an veränderte Umweltbedingungen anzupassen. Dazu verfügen Organismen über ausgeklügelte Mechanismen zur zeitlichen und räumlichen Regulierung von Proteinfunktionen. Die Entschlüsselung der Mechanismen, die diese funktionelle Plastizität biologischer Prozesse auf molekularer Ebene steuern, steht im Mittelpunkt der biologischen Grundlagenforschung und des Verständnisses von Krankheiten. Die komplexen Membrannetzwerke haben eine grundlegende Funktion bei der räumlichen Organisation von Stoffwechselwegen und anderen zellulären Prozessen. Dabei definieren Zusammensetzung und die kollektiven Eigenschaften der Lipide die Identität von Organellen. Organellenspezifische Membraneigenschaften steuern die Funktionen der Membranproteine über eng miteinander verknüpfte mechanistische Prinzipien. Dazu gehören (i) die spezifischen Wechselwirkungen mit Membranlipiden, (ii) die Auswirkungen der Dicke der Doppelschicht und der Lipidpackung auf die strukturelle Organisation der Membranen und (iii) das Zusammenspiel von Proteinen und Lipiden für Eigenschaften und Form der Membranoberfläche. Die spezifischen regulatorischen Funktionen der Membranen werden außerdem durch die laterale Segregation von Membranbestandteilen und durch die Krümmung der Membran kontrolliert. Darüber hinaus segregieren Membranproteine und Lipide an Kontaktstellen, die zwischen verschiedenen Organellen oder zwischen Krankheitserregern und Wirtsorganellen während einer Infektion entstehen. Eine solche räumliche Organisation von Membranbestandteilen findet während verschiedener Phasen des Zellwachstums oder als Reaktion auf Stressfaktoren oder Ernährungsänderungen statt. Unsere Forschungsinitiative zielt darauf ab, herauszufinden, wie die Systemeigenschaften von Membranen die Plastizität der Funktionen von Membranproteinen steuern und wie funktionsrelevante Membraneigenschaften als Reaktion auf verschiedene Umweltfaktoren erhalten und angepasst werden. Wir wollen die Mechanismen aufklären, die einer solchen funktionellen Plastizität an Membranen in verschiedenen physiologischen und pathophysiologischen Prozessen zugrunde liegen. Uns interessiert, wie funktionelle Plastizität auf allen Ebenen durch zelluläre Membrannetzwerke kodiert wird. Wir werden Lipidwerkzeuge und biomolekulare Massenspektrometrie entwickeln, um die Protein- und Lipidlandschaften auf (sub)organellarer Ebene zu kartieren, Licht- und Elektronenmikroskopie einsetzen, um die Organisation und Dynamik von Membrannetzwerken aufzulösen, und strukturbiologische Ansätze anwenden, um die Funktion und Plastizität von Membranproteinen in ihrer natürlichen Lipidumgebung aufzuklären. Unsere Projekte werden Einblicke in die physiologische Anpassung von Membraneigenschaften und deren Dysregulation bei Krankheiten geben, die durch Defekte im Lipidstoffwechsel, im Zusammenbau, im Targeting oder in der Funktion von Membranproteinen oder durch mikrobielle Infektionen verursacht werden.
DFG-Verfahren
Sonderforschungsbereiche
Laufende Projekte
- INF - Informationsinfrastruktur für den SFB 1557: Strukturierte Speicherung, Metadaten-Annotation und Analysen von experimentellen Daten (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Hensel, Michael ; Kunis, Susanne ; Möller, Arne )
- MGK - Integriertes Graduiertenkolleg (IRTG) (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Beeken, Marco ; Gonzalez Montoro, Ayelen ; Kümmel, Daniel ; Paululat, Achim )
- OR - Outreach-Projekt des SFB 1557df (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Beeken, Marco ; Cosentino, Katia )
- P01 - Umbau und Nutzung der Lipid-Trafficking-Maschinerie der Wirtszelle durch pathogene Mykobakterien (Teilprojektleiterin Barisch, Caroline )
- P02 - Bildung, Zusammensetzung und Rolle von extrazellulären Vesikeln im ischämischen Herzen (Teilprojektleiterin Bartscherer, Kerstin )
- P03 - Plastizität der zellulären Lipidverarbeitungsmaschinen bei der metabolischen Anpassung (Teilprojektleiterin Bohnert, Maria )
- P05 - Plastizität von GSDM-Poren für die Kontrolle des pyroptotischen Zelltods (Teilprojektleiterin Cosentino, Katia )
- P06 - Plastizität des Serin-Palmitoyl-Transferase-Komplexes während der Anpassung des Sphingolipid-Stoffwechsels (Teilprojektleiter Fröhlich, Florian )
- P07 - Untersuchung des Zusammenspiels zwischen der Plastizität vakuolärer Kontaktstellen und der Sphingolipid-Homöostase (Teilprojektleiterin Gonzalez Montoro, Ayelen )
- P08 - Dynamische Manipulation der funktionellen Plastizität des endosomalen Systems der Wirtszelle durch ein intrazelluläres Pathogen (Teilprojektleiter Hensel, Michael )
- P09 - Plastizität und biologische Bedeutung organellarer Lipid-Codes (Teilprojektleiter Holthuis, Joost )
- P10 - Anpassung eines Rab/GEF-Moduls bei der Initiierung und Aufrechterhaltung der planaren Zellpolarität und der Zilien (Teilprojektleiter Kümmel, Daniel )
- P11 - Membrandeterminanten für die Plastizität von ABC-Transportern (Teilprojektleiter Möller, Arne )
- P12 - Plastizität und Anpassung des endozytischen Membrankompartiments bei der Nephrozytendifferenzierung (Teilprojektleiter Paululat, Achim )
- P13 - Regulierung der Plastizität von Zytokinrezeptor-Signalen durch den subzellulären Membrankontext (Teilprojektleiter Piehler, Jacob )
- P14 - Plastizität und Anpassung des endosomalen Systems (Teilprojektleiter Ungermann, Christian )
- P15 - Plastizität und Anpassung des Protonen- und Nährstofftransports durch laterale Segregation der Plasmamembran (Teilprojektleiter Wedlich-Söldner, Roland )
- V - Zentrale Aufgaben des SFB (Teilprojektleiter Ungermann, Christian )
- Z01 - Massenspektrometrie, quantitative Lipidanalysen und Lipidwerkzeuge (Teilprojektleiter Fröhlich, Florian ; Holthuis, Joost )
- Z02 - Hochauflösende Bildgebung über räumlich-zeitliche Skalen (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Januliene, Dovile ; Kurre, Rainer ; Psathaki, Olympia-Ekaterini )
Antragstellende Institution
Universität Osnabrück
Beteiligte Hochschule
Universität Münster
Sprecher
Professor Dr. Christian Ungermann