Stoffwechselwegvorhersagen mittels Genomanalyse und Enzymkettenmodellierung

• Applicant: Professor Dr. Peer Bork
• Subject Area: Theoretical Computer Science
• Term: from 1998 to 2006
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5131248

Verschiedene Stoffwechselwegvorhersagen mittels Genomanalyse und Enzymkettenmodellierung wurden während der ersten Antragsperiode erfolgreich durchgeführt (Kohlenhydratstoffwechsel, Aminosäuren; Sekundärmetabolite, z.B. Antibiotika; nicht metabolische Kaskaden). Gleichzeitig identifizierten wir neue Herausforderungen, wie die hohe Variabilität (ausführlich dokumentiert für Glykolyse, TCA etc.) auch von zentralen Stoffwechselwegen in verschiedenen Genomen sowie komplexe Stoffwechselvernetzungen. Erarbeitete algorithmische und methodische Ansätze, insbesondere die Genom-Kontextanalyse sowie das Überoperonkonzept und Zerlegungsalgorithmen für komplexe Metabolismen werden uns nun hierzu neue und interessante Ergebnisse ermöglichen.

• DFG Programme: Priority Programmes
• Subproject of: SPP 1063: Informatikmethoden zur Analyse und Interpretation großer genomischer Datenmengen
• Participating Person: Professor Dr. Thomas Dandekar