SPP 1063:  Informatikmethoden zur Analyse und Interpretation großer genomischer Datenmengen

• Fachliche Zuordnung: Informatik, System- und Elektrotechnik
• Förderung: Förderung von 1998 bis 2004
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5469149

Keine Zusammenfassung vorhanden

• DFG-Verfahren: Schwerpunktprogramme

Projekte

• Bioinformatikanalyse der Zusammenhänge von Mutationen des HIV-Genoms mit phänotypischer Medikamentenresistenz zur Optimierung antiviraler Therapien (Antragsteller Hoffmann, Daniel )
• Bioinformatikanalyse der Zusammenhänge von Mutationen des HIV-Genoms mit phänotypischer Medikamentenresistenz zur Optimierung antiviraler Therapien (Antragsteller Kaiser, Rolf )
• Entschlüsselung und Modellierung genregulatorischer Netzwerke in Form gerichteter Graphen (Antragsteller Schneider, Ralf )
• Entwicklung eines Protein-Protein-Docking-Algorithmus und Anwendungen des Algorithmus bei der Struktur-Funktions-Analyse von Protein-Komplexen (Antragsteller Lenhof, Hans-Peter )
• Entwicklung eines Protein-Protein-Docking-Algorithmus und Anwendungen des Algorithmus bei der Struktur-Funktions-Analyse von Protein-Komplexen (Antragsteller Bayer, Peter )
• Entwicklung eines Protein-Protein-Docking-Algorithmus und Anwendungen des Algorithmus bei der Struktur-Funktions-Analyse von Protein-Komplexen (Antragsteller Scheidig, Axel J. )
• Entwicklung eines Software-Systems zum multiplen Genomvergleich (Antragsteller Ohlebusch, Enno )
• Entwicklung eines Systems zur deklarativen Beschreibung und effizienten Suche hybrider Muster in großen genomischen Datenmengen (Antragsteller Steger, Gerhard )
• Entwicklung eines Systems zur deklarativen Beschreibung und effizienten Suche hybrider Muster in großen genomischen Datenmengen (Antragsteller Kurtz, Stefan )
• Entwicklung von effizienten Methoden für das 1:n Docking von Proteinen unter Berücksichtigung lokaler Flexibilität (Antragsteller Schomburg, Dietmar )
• Entwicklung von effizienten Methoden für das 1:n Docking von Proteinen unter Berücksichtigung lokaler Flexibilität (Antragsteller Kriegel, Hans-Peter )
• Entwicklung von effizienten Methoden für das 1:n Docking von Proteinen unter Berücksichtigung lokaler Flexibilität (Antragsteller Sagerer, Gerhard )
• Entwicklung von Zielfunktionen für das segmentbasierte multiple Sequenzalignment; Entwicklung bzw. Anpassung von Optimierungsalgorithmen zum Auffinden von optimalen bzw. suboptimalen Alignments entsprechend der entwickelten Zielfunktion (Antragsteller Morgenstern, Burkhard )
• Erkennung von Genen in prokaryontischen Genomen (Antragsteller Frishman, Dmitrij )
• Flexible Beschreibung und Optimierung biologischer Randbedingungen zur Aufdeckung von Sequenz-Struktur-Beziehungen von Proteinen (Antragsteller Lengauer, Thomas )
• Flexible Beschreibung und Optimierung biologischer Randbedingungen zur Aufdeckung von Sequenz-Struktur-Beziehungen von Proteinen (Antragsteller Zimmer, Ralf )
• Functional annotation of protein sequences using machine-learning algorithms (Antragsteller Tetko, Igor V. )
• Gen- und Genomduplikationen und die Evolution neuer Genfunktionen bei Deuterostomiern (Antragsteller Meyer, Axel )
• Modellierung metabolischer Netzwerke auf der Grundlage von In-Vivo-, In-Vitro und In-Silico-Daten (Antragsteller Wiechert, Wolfgang )
• Modellierung metabolischer Netzwerke auf der Grundlage von In-Vivo-, In-Vitro und In-Silico-Daten (Antragsteller Takors, Ralf )
• Modellierung metabolischer Netzwerke auf der Grundlage von In-Vivo-, In-Vitro und In-Silico-Daten (Antragsteller Freisleben, Bernd )
• Modellierung und Animation regulatorischer Genwirknetze (Antragsteller Hofestädt, Ralf )
• Multiple Protein Alignment Algorithmen mit Splitmetriken und Validierung von Phylogenien (Antragsteller Zimmer, Ralf )
• Neue Software zur Modellierung und Annotation von Genen (Antragsteller Kleffe, Jürgen )
• Spektrale Analyse in der Bioinformatik - Ein neues Verfahren für den schnellen Vergleich großer sequenzbasierter Datenmuster als Alternative zu BLAST (Antragsteller Kauer, Gerhard )
• Stoffwechselwegvorhersagen mittels Genomanalyse und Enzymkettenmodellierung (Antragsteller Bork, Peer )
• Stoffwechselwegvorhersagen mittels Genomanalyse und Enzymkettenmodellierung (Antragsteller Schuster, Stefan )
• Systematische Genomvergleiche mit Hilfe von Positionsbäumen (Antragsteller Mewes, Hans-Werner )
• Vorhersage und Analyse von Proteinstrukturen und Struktur-Funktionsbeziehungen (Antragsteller Lengauer, Thomas )

• Sprecher: Professor Dr. Thomas Lengauer