Gen- und Genomduplikationen und die Evolution neuer Genfunktionen bei Deuterostomiern

• Antragsteller: Professor Dr. Axel Meyer
• Fachliche Zuordnung: Informatik
• Förderung: Förderung von 2001 bis 2009
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5307391

In diesem Forschungsantrag sollen Gene, die vielen verschiedenen Familien angehören, gesammelt und analysiert werden, um die Geschichte und möglichen Konsequenzen von Gen- und Genomduplikationen in Deuerostomiern zu untersuchen. So soll z.B. gezeigt werden, ob große Duplikationsereignisse mit großen Veränderungen in der Evolution der Deuterostomier einhergehen. In Bezug auf die Evolution der Fische muss geprüft werden, ob die angenommene zusätzliche Genomduplikationen der Linie der Teleostier mit einer Radiation der Fische mit heute mehr als 25.000 verschiedenen Arten korreliert. Die Gene und Genfamilien, die in dieser Studie herangezogen werden, sollen auch dazu benutzt werden, den Vorgang und das Tempo der Evolution neuer Genfunktionen zu bestimmen. Es werden z.B. Methoden angewendet, um nach positiver Selektion in duplizierten Genen zu suchen. Zusätzlich werden neue Methoden entwickelt, um die Verlässlichkeit der erhaltenen Baumtopologien, die auf nuklearen und Aminosäuresequenzen basieren, zu erhöhen.

• DFG-Verfahren: Schwerpunktprogramme
• Teilprojekt zu: SPP 1063: Informatikmethoden zur Analyse und Interpretation großer genomischer Datenmengen