Stoffwechselwegvorhersagen mittels Genomanalyse und Enzymkettenmodellierung

• Antragsteller: Professor Dr. Peer Bork
• Fachliche Zuordnung: Theoretische Informatik
• Förderung: Förderung von 1998 bis 2006
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5131248

Verschiedene Stoffwechselwegvorhersagen mittels Genomanalyse und Enzymkettenmodellierung wurden während der ersten Antragsperiode erfolgreich durchgeführt (Kohlenhydratstoffwechsel, Aminosäuren; Sekundärmetabolite, z.B. Antibiotika; nicht metabolische Kaskaden). Gleichzeitig identifizierten wir neue Herausforderungen, wie die hohe Variabilität (ausführlich dokumentiert für Glykolyse, TCA etc.) auch von zentralen Stoffwechselwegen in verschiedenen Genomen sowie komplexe Stoffwechselvernetzungen. Erarbeitete algorithmische und methodische Ansätze, insbesondere die Genom-Kontextanalyse sowie das Überoperonkonzept und Zerlegungsalgorithmen für komplexe Metabolismen werden uns nun hierzu neue und interessante Ergebnisse ermöglichen.

• DFG-Verfahren: Schwerpunktprogramme
• Teilprojekt zu: SPP 1063: Informatikmethoden zur Analyse und Interpretation großer genomischer Datenmengen
• Beteiligte Person: Professor Dr. Thomas Dandekar