Untersuchung von Sequenz-Struktur-Beziehungen im Interphasen-Chromatin (R11)

• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung seit 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 464588647

Trotz der Bedeutung der Chromatinstruktur ist unser Verständnis von Regulierungsmechanismen, die über große Entfernungen wirken können, begrenzt. Um diese Frage anzugehen, werden wir größere Mengen an Sequenzierungsdaten generieren, um Chromatin-Interaktionsmatrizen in verschiedenen Zelltypen während des Entwicklungsstadiums sowie von Patienten mit Chromosomenaberrationen zu erstellen. Diese experimentellen Daten werden wir nutzen, um Chromatinmodelle mit Vorhersagekraft zu konstruieren. Parallel dazu werden wir durch gezielte Simulationen zusätzliche Parameter (z. B. epigenetische Faktoren) identifizieren, die die Chromatinfaltung beeinflussen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1551: Polymerkonzepte zum Verstehen zellulärer Funktionen
• Antragstellende Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professorin Dr. Susanne Gerber, Ph.D.; Professorin Dr. Susann Schweiger; Dr. Peter Virnau