Evolution und Reintegration extrachromosomaler DNA (ecDNA) als Triebkraft für Progression und Metastasierung (A03)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Hämatologie, Onkologie ; Humangenetik ; Kinder- und Jugendmedizin
• Förderung: Förderung seit 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 493872418

Das Projekt untersucht die Auswirkungen von ecDNA und der Re-Integration auf die evolutionären Pfade und die klonale Dynamik des NB. Die Heterogenität in Tumor-Metastasen-Paaren wird analysiert, um Unterschiede in metastatischen Zellen zu erkennen und zu bewerten, wie verschiedene Re-Integrationsstellen zu Transkriptionsänderungen beitragen. Es werden Algorithmen entwickelt, um die Vererbung von ecDNA und ihren Beitrag zur genetischen und epigenetischen Heterogenität zwischen primären und metastasierten NBs zu untersuchen. Long-Read-Sequenzierung wird zum Nachweis von Kopienzahlveränderungen als diagnostisches Instrument eingesetzt. Ziel der Arbeiten ist es, neue Mechanismen der Tumorevolution aufzudecken.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1588: Entschlüsselung evolutionärer Mechanismen beim Neuroblastom
• Antragstellende Institution: Gemeinsam FU Berlin und HU Berlin durch:; Charité - Universitätsmedizin Berlin
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Anton Henssen; Professor Dr. Roland Schwarz