Gezielte, auf Phosphoproteomik basierende Vorhersage des Ansprechens auf eine kombinatorische Behandlung (A07)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Biochemie ; Hämatologie, Onkologie
• Förderung: Förderung seit 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 493872418

Das Projekt hat zum Ziel, analytische Methoden zu verbessern, um Zustände in Signalnetzwerken zu erkennen, die die Empfindlichkeit gegenüber Drugs vorhersagen könnten. Ein gezieltes Phosphoproteom (PP)-Panel für das NB wird entworfen, und umfassende Kataloge von On- und Off-Target-Effekten für die in Perturbationsstudien verwendeten Medikamente werden erstellt. Ein computergestütztes Tool wird entwickelt, um PP-Profile in leicht interpretierbare Aktivitätswerte von Stoffwechselwegen umzuwandeln, und dann auf ein repräsentatives Zelllinienpanel angewendet. Computermodelle werden genutzt, um Hypothesen über Resistenzmechanismen und Synergien für kombinatorische Behandlungen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1588: Entschlüsselung evolutionärer Mechanismen beim Neuroblastom
• Antragstellende Institution: Gemeinsam FU Berlin und HU Berlin durch:; Charité - Universitätsmedizin Berlin
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Nils Blüthgen; Professor Dr. Matthias Selbach