Kartierung eines Resistenzgens der Sonnenblume (Helianthus annuus L.) gegen Plasmopara halstedii und Erstellung einer BAC-Bibliothek für das Sonnenblumengenom

• Applicant: Professor Dr. Wolfgang Friedt
• Subject Area: Plant Breeding and Plant Pathology
• Term: from 1996 to 2003
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5266808

Voraussetzung für die Isolierung des Resistenzgens Pl2 ist die Absättigung der Genomregion mit eng gekoppelten flankierenden Markern. Mit Hilfe dieser Marker können dann genomische Klone aus der im Rahmen dieses Projektes entwickelten BAC-Bibliothek selektiert werden, welche die Identifizierung von Kandidatengenen erlauben. Als Ergebnis der bisherigen Arbeit konnte das Pl2-Gen mit Hilfe von RAPD-und AFLP-Markern in einem Intervall von 1,1 cM kartiert werden. Die Absättigung dieses Intervalls mit Markern sowie seine Feinkartierung soll anhand einer erweiterten F2-Population fortgesetzt werden. In einem weiteren Ansatz sollen resistenzgenhomologe Sequenzen zur Kartierung des Pl2-Locus verwendet werden. Die Arbeiten zur BAC-Klonierung des Sonnenblumen-Genoms resultierten bislang in 23.712 Klonen, die gegenwärtig eine 0,4fache Genomabdeckung darstellen. Die Anzahl der Klone soll auf etwa 100.000 erhöht werden, um eine 3-4fache Genomabdeckung zu erreichen. Gleichzeitig soll die durchschnittliche Insertgröße verbessert werden. Nach Identifizierung von BAC-Klonen, die potentiell das Pl2-Gen tragen, sollen Kandidatengene über das Screening einer geeigneten cDNA-Bank isoliert werden. Diese Kandidatengene werden schließlich in Komplementationsversuchen auf ihre Funktion geprüft.

• DFG Programme: Priority Programmes
• Subproject of: SPP 1005: Genetische und molekulare Aufklärung von Prozessen der Merkmalsausprägung bei Nutzpflanzen