Detecting selective sweeps along the Drosophila melanogaster X chromosome
Final Report Abstract
Die Lebensbedingungen von Organismen können sich im Laufe der Evolution dramatisch ändern. Wie passen sich Pflanzen und Tiere solchen Umweltveränderungen an? Welche Gene lassen sich im Genom ausmachen, die eine solche Anpassung ermöglichen? Wir haben eine von uns entwickelte Methode benützt, um im Genom von Drosophila melanogaster Spuren positiver Selektionsereignisse zu finden, die zur Adaptation führen können. Dazu haben wir ca. 260 kurze Fragmente auf dem X-Chromosom von zwei Stichproben von Fruchtfliegen sequenziert, die einer anzestralen Population aus Afrika und einer abgeleiteten Population aus Europa entnommen wurden. Da letztere Population durch die postglaziale Ausbreitung von D. melanogaster in den letzten 10 000 Jahren erst entstanden ist, erwarteten wir, dass diese Population die meisten Selektionsereignisse im Genom aufweist. Dies konnte durch statistische Verfahren auch bestätigt werden. Ferner haben wir begonnen, die Signaturen der positiven Selektion genauer zu untersuchen. Diese sind vor allem durch eine Reduktion der genetischen Variabilität gekennzeichnet (sog. selective sweeps). In einem Fall konnten wir so das Target-Gen der Selektion bestimmen.
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