Molecular recognition in RNA-ligand complexes and application to structure- and ligand-based molecular design (A 11)

• Subject Area: Theoretical Chemistry: Electronic Structure, Dynamics, Simulation
• Term: from 2004 to 2009
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5484731

Das primäre Ziel des Forschungsvorhabens ist der rechnergestützte Entwurf neuer RNA-Liganden durch fragmentbasiertes Design und neue virtuelle Screeningmethoden. Es sollen potentielle neue Liganden-Bindestellen in HIV-1 TAR RNA und dem bakteriellen Ribosom erkannt und hinsichtlich ihrer Eignung zur Ligandenbindung charakterisiert werden. Mittels de novo Design sollen RNA-Liganden mit neuen Grundgerüststrukturen entworfen, synthetisiert und gestestet werden.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 579: RNA-Ligand Interactions
• Applicant Institution: Goethe-Universität Frankfurt am Main
• Project Head: Professor Dr. Gisbert Schneider