Bioinformatische Struktur- und Interaktionsanalysen bei HCV

• Antragsteller: Dr. Mario Albrecht
• Fachliche Zuordnung: Gastroenterologie
• Förderung: Förderung von 2005 bis 2012
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5397647

Die gegenwärtig etablierte und zugelassene Therapie der Hepatitis C Virusinfektion führt in lediglich ca. 50-60% der Fälle zu einem dauerhaften Heilungserfolg. Neue Behandlungsmöglichkeiten sind daher dringend notwendig. Gegenwärtig werden Medikamente zur Inhibierung einzelner HCV-Proteine entwickelt. Für das Verständnis der HCV-Infektion, der Wirkung von Medikamenten, und von möglichen Resistenzmechanismen ist die Kenntnis der 3D-Struktur der HCV Proteine, ihren molekularen Funktionen, und ihren Interaktionen mit humanen Proteinen von wesentlicher Bedeutung. Daher sollen HCV-Proteine und ihre Interaktionspartner strukturell modelliert werden, Sequenzmutationen auf die Struktur abgebildet werden und ihre funktionellen Effekt evaluiert und vorhergesagt werden. Hierfür stehen Resistenzmutationen aus klinischen Studien zur Verfügung. Mit Hilfe der entwickelten Struktur-Funktion-Modelle können Sequenzunterschiede von HCV-Isolaten einzelner Patienten hinsichtlich ihrer funktionellen Relevanz untersucht werden, um Hypothesen für weitere Experimente über Binde- und Resistenzgeschehen aufzustellen. Hierfür sollen unterstützend Analysen und Vorhersagen von humanen und viralen Proteininteraktionen durchgeführt und mit statistischen Konfidenzwerten versehen werden.

• DFG-Verfahren: Klinische Forschungsgruppen
• Teilprojekt zu: KFO 129: Mechanismen der Resistenzentwicklung und Optimierung antiviraler Strategien bei Hepatitis C Virusinfektion unter Einbeziehung integrativer Modelle der Biomathematik und Bioinformatik
• Beteiligte Person: Professor Dr. Thomas Lengauer