Bioinformatische Struktur- und Interaktionsanalysen bei HCV

• Applicant: Dr. Mario Albrecht
• Subject Area: Gastroenterology
• Term: from 2005 to 2012
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5397647

Die gegenwärtig etablierte und zugelassene Therapie der Hepatitis C Virusinfektion führt in lediglich ca. 50-60% der Fälle zu einem dauerhaften Heilungserfolg. Neue Behandlungsmöglichkeiten sind daher dringend notwendig. Gegenwärtig werden Medikamente zur Inhibierung einzelner HCV-Proteine entwickelt. Für das Verständnis der HCV-Infektion, der Wirkung von Medikamenten, und von möglichen Resistenzmechanismen ist die Kenntnis der 3D-Struktur der HCV Proteine, ihren molekularen Funktionen, und ihren Interaktionen mit humanen Proteinen von wesentlicher Bedeutung. Daher sollen HCV-Proteine und ihre Interaktionspartner strukturell modelliert werden, Sequenzmutationen auf die Struktur abgebildet werden und ihre funktionellen Effekt evaluiert und vorhergesagt werden. Hierfür stehen Resistenzmutationen aus klinischen Studien zur Verfügung. Mit Hilfe der entwickelten Struktur-Funktion-Modelle können Sequenzunterschiede von HCV-Isolaten einzelner Patienten hinsichtlich ihrer funktionellen Relevanz untersucht werden, um Hypothesen für weitere Experimente über Binde- und Resistenzgeschehen aufzustellen. Hierfür sollen unterstützend Analysen und Vorhersagen von humanen und viralen Proteininteraktionen durchgeführt und mit statistischen Konfidenzwerten versehen werden.

• DFG Programme: Clinical Research Units
• Subproject of: KFO 129: Mechanisms for Development of Resistance and Optimisation of Antiviral Strategies of Hepatitis C Virus Infection Comprising Integrative Biomathematical and Bioinformatical Models
• Participating Person: Professor Dr. Thomas Lengauer