Mutationssensitive Vorhersage von Transkriptionsfaktor-DNA-Wechselwirkungen in Pflanzen (A03)

• Fachliche Zuordnung: Genetik und Genomik der Pflanzen ; Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Evolution und Systematik der Pflanzen und Pilze ; Strukturbiologie
• Förderung: Förderung seit 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 514901783

In diesem Bioinformatik-Projekt wird die Interaktion zwischen Transkriptionsfaktor (TF)-Proteoformen und ihren cis-regulierenden Zielpromotoren analysiert. Durch die Integration der Identifizierung von Mustern auf DNA-Ebene und der 3-D-Strukturmodellierung werden die doppelten Auswirkungen der genomischen Variation auf die TF-Funktion untersucht, mit Fokus auf strukturellen Unterschieden in DNA-bindenden Domänen und nicht-kodierenden genetischen Variationen in Promotoren. Die simultane Analyse dieser beiden Ebenen ermöglicht das Verstehen der Co-Evolution von TFs und ihren Bindungsstellen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1664: Diversität pflanzlicher Proteoformen - SNP2Prot
• Antragstellende Institution: Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Ivo Große; Professor Dr. Jens Meiler