Entwicklung von SNPstar 2.0 und einer bioinformatischen Vorhersage von Proteoformen mit funktioneller Variation (D02)

• Fachliche Zuordnung: Genetik und Genomik der Pflanzen ; Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Evolution und Systematik der Pflanzen und Pilze
• Förderung: Förderung seit 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 514901783

Das Genomics-basierte D02 zielt auf die Entwicklung von SNPstar 2.0 und die Vorhersage von Proteoform-Kandidaten mit hoher funktioneller Variation auf der Grundlage genomischer Daten ab. Das mit Strukturmodellen aus D01 erweiterte SNPstar 2.0 wird ausserdem die nsSNPs auf der Struktur abbilden und auf andere Pflanzenarten ausgeweitet. Das Projekt wird einen quantitativen Score für SNP-Effekte auf Struktur und Funktion von Proteoformen einführen. Dieser Score unterstützt Auswahl von funktionell divergenten Proteoformen für die experimentelle Analyse in der zweiten Förderperiode.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1664: Diversität pflanzlicher Proteoformen - SNP2Prot
• Antragstellende Institution: Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Ivo Große; Professor Dr. Marcel Quint