SFB 628:  Functional Membrane Proteomics - From Transport Machineries to Dynamic Assemblies and Networks

• Fachliche Zuordnung: Biologie
• Förderung: Förderung von 2003 bis 2007
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5485691

Die Analyse von Membranproteinen stellt eine der besonderen Herausforderungen der Biowissenschaften und Medizin dar. In der lebenden Zelle sind Membranproteine an vielen grundlegenden Reaktionen beteiligt. So ist jedes dritte menschliche Gen an Membranprozessen, wie der Zell-Zell-Kommunikation, dem Weiterleiten von Signalen, dem Stofftransport und dem Zellaufbau, beteiligt und steht daher im Zentrum der Pharmaforschung. Trotz ihrer überaus großen Zahl ist bislang lediglich die Struktur von weniger als 30 Membranproteinen aus verschiedenen Organismen entschlüsselt worden. Im Rahmen unseres Sonderforschungsbereichs werden die Funktion und die Struktur unterschiedlicher Gruppen von membranassoziierten Protein-Komplexen und -Netzwerken mit einem breiten Spektrum an biochemischen, biophysikalischen, genetischen und zellbiologischen Techniken sowie der Methodik der Proteom-Analyse erforscht. Die Forscher interessieren sich insbesondere dafür, wie komplexe Membrantransportmaschinerien aufgebaut und wie Proteine in der Membran miteinander kommunizieren und in dynamischen Netzwerken organisiert sind. An diesem Forscherverbund sind Gruppen aus den Fachbereichen Biologie und Informatik (3), Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften (6) und Medizin (3) sowie aus den Max-Planck-Instituten für Biophysik (3) und Hirnforschung (1) beteiligt.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Internationaler Bezug: USA

Abgeschlossene Projekte

• A01 - Structure and Function of Arcaeal Membrane Transporters (Teilprojektleiter Kühlbrandt, Werner )
• A02 - Function of the Transport Complex TAP (Teilprojektleiter Abele, Rupert ;  Tampé, Robert )
• A03 - Solid-state NMR on ABC Multidrug Transporter LmrA (Teilprojektleiter Glaubitz, Clemens )
• B01 - Differential Partners and Dynamics of Membrane Protein Shrew-1 in Polarized and Non-Polarized Cells (Teilprojektleiterin Starzinski-Powitz, Anna )
• B02 - Viral and Instrinsic Modulators (Teilprojektleiter Tampé, Robert )
• B04 - Function of Reggie Proteins in Cell Adhesion and Membrane Receptor Trafficking (Teilprojektleiterin Tikkanen, Ritva )
• B05 - Dynamics of Type I Interferon Receptor Assembly (Teilprojektleiter Piehler, Jacob )
• B06 - NMR Investigations of Mammalian Rhodopsin and of Membrane-associated Protein GARP2 (Teilprojektleiter Schwalbe, Harald )
• C01 - Structural Membrane Proteomics and Genomics Using the Hyperthermophilic Eubacterium Aquifex aeolicus (Teilprojektleiter Michel, Hartmut )
• C02 - Characterization of Membrane Protein Complexes (Teilprojektleiter Karas, Michael ;  Schägger, Hermann )
• C03 - Proteomics of Large Membrane Protein Assemblies: The Accessory Subunits of Mitochondrial Complex I (Teilprojektleiter Brandt, Ulrich )
• C04 - Structural and Functional Investigation of Membrane Proteins by Combined Approaches of Cell-Free Expression and NMR Spectroscopy (Teilprojektleiter Bernhard, Frank ;  Dötsch, Volker )
• C05 - Proteomic Analysis of Postsynaptic Receptor Complexes (Teilprojektleiter Betz, Heinrich )
• C06 - The Synaptic Vesicle Proteome: Identification and Functional Characterization of Novel Constituents (Teilprojektleiter Volknandt, Walter ;  Zimmermann, Herbert )
• C07 - Functional Analysis of Novel Proteins Associated with Nicotinic Acetylcholine Receptors and Synaptic Vesicles in Caenorhabditis elegans (Teilprojektleiter Gottschalk, Alexander )
• P04 - Protein Transport Across Biological Membranes - the HlyB/HlyA System from E.coli (Teilprojektleiter Schmitt, Lutz )
• P05 - Structural and Functional Analysis of Protein Translocation (Teilprojektleiter Collinson, Ian )
• P06 - Molecular Cross Talk at the Endothelial Membrane (Teilprojektleiter Müller-Esterl, Werner )
• P07 - Funkctional Dynamics of Shrew-1 in Epithelial Adherens Junctions (Teilprojektleiterin Starzinski-Powitz, Anna )
• P08 - Viral Inhibitors of the Antigen Processing Machinery (Teilprojektleiter Tampé, Robert )
• P10 - Dynamics of Type I-Interferon Receptor Assembly (Teilprojektleiter Piehler, Jacob )
• P11 - High Resolution Spectroscopy Investigations of T-Cell Activation and G Protein Coupled Receptors (Teilprojektleiter Schwalbe, Harald )
• P12 - Membrane Proteomics using the Hyperthermophilic Eubacterium Aquifex Aeolicus (Teilprojektleiter Michel, Hartmut )
• P13 - Characterization of Membrane Protein Complexes (Teilprojektleiter Karas, Michael ;  Schägger, Hermann )
• P14 - Proteomics of Large Membrane Protein Assemblies: the Accessory Subunits of Mitochondrial Complex I (Teilprojektleiter Brandt, Ulrich )
• P15 - Proteomic Analysis of Postsynaptic Receptor Complexes (Teilprojektleiter Betz, Heinrich ;  Kneussel, Ph.D., Matthias )
• P16 - The Synaptic Vesicle Proteome under conditions of Rest and Activation (Teilprojektleiter Volknandt, Walter ;  Zimmermann, Herbert )
• P17 - Proteomic and funkctional analysis of pre- and post-synaptic componentes in Caenorhabditis elegans (Teilprojektleiter Gottschalk, Alexander )
• P18 - Strukturelle und funktionelle Analyse integraler Membranproteine (Teilprojektleiter Dötsch, Volker )
• P19 - Functional characterization of the reggie protein family: posttranslational modifications and signaling partners (Teilprojektleiterin Tikkanen, Ritva )
• Z01 - Zentrale Aufgaben (Teilprojektleiter Tampé, Robert )

• Antragstellende Institution: Goethe-Universität Frankfurt am Main
• Beteiligte Institution: Max-Planck-Institut für Biophysik; Max-Planck-Institut für Hirnforschung
• Sprecher: Professor Dr. Robert Tampé