Modellierung von Reibungskräften in der Proteindynamik (A07)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung von 2010 bis 2012
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 111166240

Aufgrund der Hydrierung und des hohen Grads der Verschlaufung der Polypeptidketten während Proteinfaltungs-, -assemblierungs- oder auch Transportvorgängen, dominieren Reibungskräfte die Response von Proteinen auf externe Störungen. Das Ziel dieses Projekts ist ein theoretisches Studium von intra-Ketten-Reibung sowie Lösungsmittel-induzierter Reibung in Proteinen, um ein detailliertes, mikroskopisches Verständnis biomolekularer Mechanik zu erreichen. In enger Zusammenarbeit mit den Experimenten aus den Projekten A2, A6 und A8 werden wir die dynamische und kinetische Response von Proteinfragmenten untersuchen. Dabei werden atomistische und coarse-grained Computersimulationen zum Einsatz kommen, die schlussendlich zu einer reduzierten Fokker-Planck-Beschreibung der Diffusion in einer schematischen, rauen Energielandschaft führen werden.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 863: Kräfte in biomolekularen Systemen
• Antragstellende Institution: Technische Universität München (TUM)
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Joachim Dzubiella, bis 6/2010; Professor Dr. Roland Netz, von 7/2010 bis 7/2011