Evolutionäre Innovationen - eine Fallstudie über Chromatin-Insulator-proteine (C04)

• Fachliche Zuordnung: Evolutionäre Zell- und Entwicklungsbiologie der Tiere
• Förderung: Förderung von 2006 bis 2017
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 13532522

Ausgehend von den algorithmischen Vorarbeiten zu alignment-freiem Genomvergleich durch küzeste eindeutige substrings (shustrings), soll die Theorie von shustrings weiterentwickelt und in Populationsgenetik und komparativer Genomik angewendet werden. Insbesondere sollen mit Hilfe von shustrings neue Tests für positive Selektion entwickelt werden, die nicht nur das Frequenzspektrum von Polymorphismen, sondern auch deren räumliche Verteilung auf einem Chromosom ausnutzen. Mit Hilfe von shustrings lassen sich effizient Phylogenien kompletter Genome rekonstruieren und der Grad von Homologie zwischen Sequenzen quantifizieren. Wir werden diese Methode weiterentwickeln, um durch Genomvergleich in Bakterien die Raten von horizontaler und vertikaler Evolution und deren relative Rolle für spezies- oder stammspezifische Adaptation zu bestimmen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 680: Molekulare Grundlagen evolutionärer Innovationen
• Antragstellende Institution: Universität zu Köln
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Thomas Wiehe