Neue Techniken zur Kartographierung von Modifikationen und die Anwendung in der Einzelzell-Epitranskriptomik (C01)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 439669440

Verschiedene Methoden der Epitranskriptomik auf Einzelzellebene werden untersucht und entwickelt. Etablierte als auch neu entwickelte Techniken zur Kartierung von Modifikationen werden auf ihre biochemische Kompatibilität mit einer spezifischen Variante der Einzelzell-RNA-Sequenzierung untersucht. Anpassungen werden für ein Maximum an Modifikationen und RNA-Spezies implementiert, mit dem Ziel, einen epitranskriptomischen Atlas für die Embryogenese von Wirbeltieren anhand von Zebrafisch-Embryonen als Modell zu erstellen.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 319: RMaP: RNA Modifikation und Prozessierung
• Antragstellende Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professor Dr. Mark Helm; Professor Dr. Andreas Hildebrandt, bis 12/2025; Professorin Dr. Lauren Saunders; Professor Dr. Bertil Schmidt, bis 12/2025