SFB 593:  Mechanismen der zellulären Kompartimentierung und deren krankheitsrelevante Veränderungen

• Fachliche Zuordnung: Medizin ; Biologie
• Förderung: Förderung von 2003 bis 2014
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5485539

Ziel ist das Verständnis der molekularen Grundlagen der zellulären Kompartimentierung und deren Bedeutung für die Entstehung von Krankheiten. Untersucht werden bedeutende und hochaktuelle Fragestellungen der modernen Zellbiologie wie z.B. die intrazelluläre Verteilung von Proteinen, RNA und Metallen auf die verschiedenen Organellen, die Assemblierung von Plasmamembrantransportern, die intrazelluläre Reifung und Verpackung hochpathogener Viren und die Vorgänge bei der Kompartimentierung von intrazellulären Pathogenen. Von Interesse ist ebenso, wie die molekulare Funktion einzelner Proteine und Proteinkomplexe ('molecular machines') umgesetzt wird in die Bildung, strukturelle Organisation und Aufrechterhaltung von intrazellulären Kompartimenten.
Neben diesen grundlegenden Fragestellungen wird sich der SFB mit dem wichtigen Problem befassen, wie sich Störungen der Kompartimentierung auf die Kompartimente selbst, auf die gesamte Zelle oder auf den ganzen Organismus auswirken. Der SFB wird in seiner Arbeit die klassischen Vorgehensweisen der Biochemie, Genetik, Molekularbiologie, Parasitologie, Physiologie, Strukturbiologie, Virologie und Zellbiologie kombinieren mit modernen Methoden der ‘Genomics’ und ‘Proteomics’. Als Studienobjekte stehen neben Säuger-Zellkulturen eine Reihe von Modellorganismen wie die Hefe und transgene Mäuse zur Verfügung. Außerdem werden gentechnisch veränderte Parasiten und Viren in geeigneten Hochsicherheitslaboratorien untersucht. Der Vergleich von zellulären Vorgängen in gesunden und in pathologisch veränderten Zellen wird ermöglichen, viele noch wenig bekannte Prozesse auf molekularer Ebene zu definieren und die Veränderungen bei Krankheiten detailliert zu beschreiben.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Internationaler Bezug: Frankreich

Abgeschlossene Projekte

• A01 - Die Rolle der Mitochondrien bei der Reifung cytosolischer Eisen-Schwefel Proteine (Teilprojektleiter Lill, Roland )
• A02 - Mechanismus und Regulation der Kompartimentierung von Eisen zwischen Mitochondrien und Cytosol (Teilprojektleiter Mühlenhoff, Ulrich )
• A03 - Aufbau, zelluläres Targeting und Funktion von Kanalkomplexen Proteinkinase-gekoppelter Kationenkanäle der TRPM-Subfamilie (Teilprojektleiter Gudermann, Thomas ;  Schlingmann, Karl Peter ;  Waldegger, Siegfried )
• A04 - Intrazellulärer Transport von Kaliumkanälen (Teilprojektleiter Daut, Jürgen )
• A06 - Die Rolle spezifischer RNA-bindender Proteine beim Transport von mRNA aus dem Zellkern in das Cytoplasma (Teilprojektleiterin Krebber, Heike )
• A07 - Kompartimentierung des Abbaus von Myc (Teilprojektleiter Eilers, Martin )
• A09 - Identifikation von Vesikelkomponenten des apikalen Proteintransports (Teilprojektleiter Jacob, Ralf )
• A10 - Importance and regulation of edocytoic recycling and bidirectional endosome motility (Teilprojektleiter Steinberg, Gero )
• A11 - Endotheliale Caveolae als mechanosensitive Mikrokompartimente und ihre Rolle bei Hypertonie und Niereninsuffizienz (Teilprojektleiter Hoyer, Joachim )
• A12 - Kompartiment-spezifische Phosphoinositid-Dynamik in einem zentralen Neuron (Teilprojektleiter Oliver, Dominik )
• A13 - Kinetische und strukturelle Aspekte der G-Protein vermittelten Signaltransduktion (Teilprojektleiter Bünemann, Moritz )
• A14 - Kompartmentierung und Regulation durch Sumoylierung von SCAI (Teilprojektleiter Grosse, Robert )
• A15 - Molecular mechanismus underlying regulated transport and processing of neuronal microRNAs in the postsynaptic compartment (Teilprojektleiter Schratt, Ph.D., Gerhard Martin )
• A16 - The importance of TRPMI and TRPM3 channel proteins for the establishment and function of the postsynaptic dendritic compartment of retinal bipolar cells (Teilprojektleiter Oberwinkler, Johannes )
• B01 - Wechselwirkung zwischen Polymerase und Hämagglutinin von Influenzaviren mit Wirtsfaktoren und deren Bedeutung für Pathogenese und Wirtswechsel (Teilprojektleiter Klenk, Hans-Dieter )
• B02 - Influenzaviren - aktivierende Proteasen der Atemwege: Identifikation, Charakterisierung und zelluläre Lokalisation (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Böttcher-Friebertshäuser, Eva ;  Garten, Wolfgang )
• B03 - Morphogenese und Transport von Nukleokapsidkomplexen des Marburg-Virus (Teilprojektleiter Becker, Stephan )
• B04 - Reverse genetics system for Ebola virus - molecular basis of high pathogenicity (Teilprojektleiter Volchkov, Viktor )
• B05 - Struktur und Funktion von viralen Matrixproteinen (Teilprojektleiter Weissenhorn, Winfried )
• B07 - Biogenese und Bedeutung der parasitophoren Vakuole apicomplexer Parasiten in humanen Erythrozyten (Teilprojektleiter Lingelbach, Klaus )
• B09 - Protein transport into complex plastids (Teilprojektleiter Maier, Uwe Gallus )
• B10 - The role of selected Ustilago maydis proteins during pathogenesis (Teilprojektleiterin Kahmann, Regine )
• B11 - Role of the endosomal compartment in Nipah virus replication (Teilprojektleiterin Maisner, Andrea Susanne )
• B12 - Morphogenesis und Transport von Filovirus Nucleokapsiden (Teilprojektleiter Becker, Stephan )
• B13 - Störungen der nukleären und nukleolären Kompartimente durch einen viralen Interferon-Antagonisten (Teilprojektleiter Weber, Friedemann )
• N01 - Roles of differentially localized glutaredoxin 2 isoforms (Teilprojektleiter Lillig, Christopher Horst )
• N01 - N01 - Roles of differentially localized glutaredoxin 2 isoforms (Teilprojektleiter Lillig, Christopher Horst )
• Z01 - Central tasks of the Collaborative Research Centre (Teilprojektleiter Lill, Roland )
• Z02 - Proteinanalytik (Teilprojektleiter Lingelbach, Klaus )

• Antragstellende Institution: Philipps-Universität Marburg
• Beteiligte Institution: European Molecular Biology Laboratory (EMBL) Grenoble; Max-Planck-Institut für terrestrische Mikrobiologie; Université Claude Bernard Lyon 1
• Sprecher: Professor Dr. Roland Lill