Präzisions-Nanoporen-Sequenzierung von RNA-Modifikationen und RNA-Prozessierungsereignissen (C04*)

• Fachliche Zuordnung: Biochemie
• Förderung: Förderung seit 2026
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 439669440

Die direkte RNA-Sequenzierung (DRS) mittels Nanoporen kann RNA-Modifikationen auf einzelnen Molekülen erkennen, hat jedoch Probleme mit der Präzision und der Sequenzierung strukturierter RNAs. Aktuelle Protokolle sind auf polyadenylierte RNAs beschränkt, und es fehlen maßgeschneiderte Strategien für die selektive Sequenzierung. Das Projekt C04 hat es zum Ziel neue DRS-Ansätze zu entwickeln und Protokolle zu optimieren, um die Sequenzierungsgenauigkeit sowie die Erkennung von RNA-Modifikationen zu verbessern. Wir werden RNA-Standards, Qualitätskontrollmaßnahmen und realistische Benchmarks festlegen, um die Bewertung der Softwareleistung zu verbessern. Des Weiteren werden wir die wissenschaftliche Gemeinschaft durch RMaP-Challenges und Hackathons in unser Projekt mit einbeziehen.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 319: RMaP: RNA Modifikation und Prozessierung
• Antragstellende Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professor Dr. Christoph Dieterich; Professorin Susanne Gerber, Ph.D.