Massenspektrometrie von RNA und Proteinen in modifizierten RNPs (C03)

• Fachliche Zuordnung: Biochemie
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 439669440

Kovalente Vernetzungen von Proteinen mit der RNA im Zellkern oder im Zytoplasma können die Transkription bzw. Translation hemmen. Wir haben kürzlich festgestellt, dass RNA-Protein-Querverbindungen (RPCs) in der mRNA im Zytoplasma in einem speziellen, mit der Translation verbundenen Qualitätskontrollweg aufgelöst werden. In diesem Projekt werden wir massenspektrometriebasierte Ansätze zur Analyse von RPCs und damit verbundenen RNA-Modifikationen entwickeln. Wir werden untersuchen, welche RNA-Modifikationen in nukleären und zytoplasmatischen RPCs vorhanden sind, und die Rolle der identifizierten Modifikationen bei der Regulierung der Verarbeitung von vernetzter RNA und damit der RPC-Auflösung definieren.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 319: RMaP: RNA Modifikation und Prozessierung
• Antragstellende Institution: Johannes Gutenberg-Universität Mainz
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professorin Dr. Petra Beli; Dr. Falk Butter, bis 12/2025; Professor Dr. Mark Helm; Professor Dr. Andres Jäschke, bis 12/2025