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TRR 353: Regulation von Entscheidungen in Zelltodprozessen
Fachliche Zuordnung
Biologie
Medizin
Medizin
Förderung
Förderung seit 2023
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 471011418
Der Tod einzelner Zellen ist ein häufiges Ereignis in einem Säugetierorganismus, und Störungen des Zelltods können erhebliche Folgen für die menschliche Gesundheit haben. In wohl den meisten Fällen ist Zelltod reguliert, d. h. er wird durch zelleigene Signaltransduktion ausgelöst. Die bestuntersuchte Form, die Apoptose, ist seit etwa 50 Jahren bekannt. In jüngerer Zeit wurden weitere Zelltodmodalitäten entdeckt, wie Nekroptose, Pyroptose, Ferroptose und Oxeiptose. Eine Vielzahl von Signalschritten bei Zelltodprozessen wurde beschrieben. Bei der Vielzahl der untersuchten Zellarten, Überschneidungen von Zelltodwegen mit anderen Signalereignissen und den getrennten, aber ähnlichen Aktivitäten einzelner Zelltod-Signalkomponenten ist es nicht möglich, ein umfassendes konzeptionelles oder mechanistisches Bild des Zelltods im menschlichen Körper zu zeichnen. Wir glauben, dass ein entscheidender Punkt auf dem Weg zum Verständnis des Zelltods darin besteht, zu verstehen, wie eine Zelle die Entscheidung trifft zu sterben. Diese Entscheidung hat mehrere Ebenen, und zwei wichtige Aspekte sind die molekulare Entscheidung, eine bestimmte Form des Zelltods zu initiieren, und die Entscheidung für die Wahl der Zelltodmodalität. Diese beiden Schlüsselaspekte bilden den Schwerpunkt dieses Programms. Im Bereich A werden wir versuchen, die Entscheidung, zu sterben, zu verstehen. Wir definieren verschiedene Ausgangspunkte, von denen diese Entscheidung ausgehen kann: Die Ebene der Stressintegration, der Signalintegration durch identifizierte Knotenpunkte oder die terminale Ausführung des Zelltods. So werden Signale durch Todesrezeptoren, Signale, die durch eine Infektion mit beispielhaften Krankheitserregern erzeugt werden, oder Signale, die durch multifunktionale Transkriptionsfaktoren erzeugt werden, untersucht. Entscheidungen von Signalkomplexen wie dem Tod-auslösenden Signalkomplex an Membranrezeptoren und der mitochondrialen BCL-2-Familie werden ebenso untersucht wie die Exekution durch Membranporen. Die Projekte werden sich mit der Frage nach der Wahl der Zelltodmodalität befassen. Selbst identische Stimuli können unterschiedliche Formen des Zelltods auslösen. Wie diese Entscheidung getroffen wird, ist fast völlig unklar. Die Projekte werden etwa die Abhängigkeit dieser Entscheidung vom Zelltyp, die Rolle des subzellulären Ursprungs des Signals und die post-translationalen Modifikationen von Signalmolekülen und -komplexen testen. Das Spektrum reicht von grundlegenden biophysikalischen Fragen bis zur klinischen Anwendung. Die einzelnen Projekte erreichen Kohärenz - zusätzlich zu den beiden konzeptionellen Hauptfragen - durch den Fokus auf eine begrenzte Anzahl von Zelltodmodalitäten und auf gemeinsame Signalmoleküle und Knotenpunkte. Zwei Serviceprojekte unterstützen die wissenschaftlichen Projekte. Die Arbeit dieses Konsortiums wird dazu beitragen, grundlegende Prinzipien von Zelltodentscheidungen in Biologie und Pathologie zu definieren.
DFG-Verfahren
Transregios
Laufende Projekte
- A01 - Apoptose und Überleben als Antwort auf TRAIL-vermittelte Signale in der humanen B Zellhomöostase (Teilprojektleiterin Rizzi, Marta )
- A02 - Mikrobielle Regulation der Zelltodinduktion im intestinalen Trakt (Teilprojektleiterin Yabal, Monica )
- A03 - Determinanten des mitochondrialen Zelltodes in Virus-infizierten Hepatozyten (Teilprojektleiter Wohlleber, Dirk )
- A05 - Untersuchungen zur Basis von durch p53-Mutanten vermittelten Zelltodentscheidungen (Teilprojektleiter Amelio, Ivano ; Gruber, Andreas )
- A06 - Untersuchungen von durch konstitutivem RAS induzierten Zelltyp-spezifischen Entscheidungsprozessen (Teilprojektleiterin Erlacher, Miriam )
- A07 - Untersuchungen zur dynamischen Ausbildung von Signalkomplexen in extrinsischen und intrinsischen Telltodprozessen mittels MS-basierter Proteomanalyse (Teilprojektleiter Brunner, Thomas ; Stengel, Florian )
- A08 - Große BCL-2-Proteinkomplexe in der äußeren mitochondrialen Membran und deren Rolle in Entscheidungsprozessen der Apoptose (Teilprojektleiter Häcker, Georg )
- A09 - Entscheidungen zwischen lokaler Mitophagie und neuronalem Zelltod (Teilprojektleiterin Harbauer, Angelika )
- A10 - Todes-Poren: Entscheidungsprozesse in der Exekution der regulierten Nekrose (Teilprojektleiterin Garcia Sáez, Ana Jesús )
- B01 - Wirtszell-Entscheidungen zwischen Apoptose, Nekroptose und Überleben nach Infektion durch das Herpes simplex Virus-1 (HSV-1) (Teilprojektleiter Borner, Christoph )
- B02 - Die Rolle der RIP Kinase 1 in der Entscheidung zwischen Apoptose- und Pyroptose-Induktion während intrazellulärer bakterieller Infektion (Teilprojektleiter Ebert, Gregor )
- B03 - Die Rolle von SPATA2 in Entscheidungsprozessen zwischen Überleben und Zelltod (Teilprojektleiter Maurer, Ulrich )
- B04 - Ausschlaggebende Faktoren in der Induktion von Zelltod durch Oxeiptose und der Bezug zu anderen Formen des regulierten Zelltodes (Teilprojektleiter Pichlmair, Andreas )
- B05 - Entscheidungsprozesse im oxidativen Zelltod als Antwort auf lokale Peroxid-Provokationen (Teilprojektleiter Conrad, Marcus )
- B06 - Untersuchung von Entscheidungsprozessen zwischen Ferroptose und Apoptose (Teilprojektleiter Morrison, Markus )
- B07 - Metabolische Faktoren in neuronalen Zelltod-Entscheidungen (Teilprojektleiter Leist, Marcel )
- B08 - TNF-Rezeptorfamilie-vermittelte Signale in der Modulation von Entscheidungsprozessen zwischen apoptotischem und nekrotischem Leberzelltod (Teilprojektleiter Brunner, Thomas )
- MGK - Integriertes Graduiertenkolleg „Death Decisions“ (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Amelio, Ivano ; Harbauer, Angelika ; Rizzi, Marta )
- SP01 - Globale und zielorientierte Proteomanalyse in der Zelltodinduktion (Teilprojektleiterin Mergner, Julia )
- SP02 - Bioinformatik für die Analyse und Integration von Hochdurchsatzdaten in Zelltod-Entscheidungsprozessen (Teilprojektleiterin Börries, Melanie )
- Z - Allgemeine Aufgaben des TRR 353 (Teilprojektleiter Brunner, Thomas )
Antragstellende Institution
Universität Konstanz
Mitantragstellende Institution
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg; Technische Universität München (TUM)
Partnerorganisation
Fonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung (FWF)
Beteiligte Hochschule
Medizinische Universität Innsbruck; Universität Stuttgart; Universität zu Köln
Beteiligte Institution
Helmholtz Zentrum München
Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt; Max-Planck-Institut für biologische Intelligenz
Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt; Max-Planck-Institut für biologische Intelligenz
Sprecher
Professor Dr. Thomas Brunner