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Institution

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Universität Leipzig
Institut für Informatik
Lehrstuhl für Bioinformatik

Adresse Härtelstraße 16-18
04107 Leipzig
Deutschland

GERiT Diese Institution in GERiT

04107 Leipzig

Projekte

Schwerpunktprogramme
- laufende Projekte
  - Die Evolution epigenetischer Regulation in Käfern (Coleoptera)
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Kurtz, Joachim ; Prohaska, Sonja )
  - Prävalenz, Bildung und Funktion von "fremden" CRISPR-RNAs ausgehend vom “extra repeat” von CRISPR-Arrays
    (Antragsteller Beisel, Chase ; Weinberg, Ph.D., Zasha )
  - Syntenie-basierte Identifikation von Innovationen in Insektengenomen
    (Antragsteller Lemke, Steffen ; Stadler, Peter Florian )
  - Virtuelles Wirkstoff-Screening und Synthese-Zugänglichkeit
    (Antragsteller Meiler, Jens ; Stadler, Peter Florian )
- abgeschlossene Projekte
  - Computational Detection of Bacterial ncRNAs and their Targets
    (Antragsteller Backofen, Rolf ; Stadler, Peter Florian )
  - Die Rolle von Langen Nicht-Kodierenden RNAs in der Evolution des Primatengehirns
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Nowick, Katja ; Stadler, Peter Florian )
  - Evolution von chemischen Modifikation: von tRNAs bis zu transkriptom-weiten Studien
    (Antragsteller Mörl, Mario ; Stadler, Peter Florian )
  - Genotype-Phenotype Maps and Signatures of Selection in Genomic Sequences
    (Antragsteller Stadler, Peter Florian )
  - Molecular Morphology: Deep Phylogeny Using RNA Structures and Related Markers
    (Antragsteller Stadler, Peter Florian )
  - Refined Methods for Inference of Metazoan Phylogeny Using Mitochondrial Genome Arrangement Data
    (Antragsteller Schierwater, Bernd )
  - Refined Methods for Inference of Metazoan Phylogeny Using Mitochondrial Genome Arrangement Data
    (Antragsteller Schierwater, Bernd ; Stadler, Peter Florian )
  - Verbesserte Vorhersage und Identifikation von kleinen Proteinen und deren Funktion in Konsortien, die dem menschlichen Mikrobiom aehneln
    (Antragsteller von Bergen, Martin ; Stadler, Peter Florian )
Sachbeihilfen
- laufende Projekte
  - Analyse des Krebs Imprintomes und der damit assoziierten langen nicht-kodierenden RNAs
    (Antragsteller Stadler, Peter Florian )
  - Armlose Miniatur-tRNAs – Funktion, Interaktion, Modifikation
    (Antragsteller Mörl, Mario ; Stadler, Peter Florian )
  - Automatische Reduzierung von Falsch-Positiv-Raten für Homologiesuchen nach RNAs in riesigen Datensätzen
    (Antragsteller Weinberg, Ph.D., Zasha )
  - CCA-addierende Enzyme mit erhöhter Substrat-Affinität: Strategien und Konsequenzen der Adaptation an RNA-Substrate
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Mörl, Mario ; Prohaska, Sonja )
  - Identifizierung und Charakterisierung neuer Klassen strukturierter RNAs in Pflanzen
    (Antragsteller Wachter, Ph.D., Andreas ; Weinberg, Ph.D., Zasha )
  - Kombinatorische Methoden zur verbesserten Identifikation von Orthologen in großen Datensätzen
    (Antragsteller Stadler, Peter Florian )
  - RNA-seq-basiertes Screening nach aktiven selbst-schneidenden Ribozymen und transkriptomweite Untersuchung ihrer regulatorischen Funktionen
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Fallmann, Ph.D., Jörg ; Weinberg, Christina E. )
  - RNA-Struktur-Analyse im Hochdurchsatzverfahren mittels spezifischer Ligation von cyclo-Phosphat-Enden und Deep Sequencing
    (Antragsteller Mörl, Mario ; Stadler, Peter Florian )
- abgeschlossene Projekte
  - Algorithmen zur Rekonstruktion von Ko-Phylogenien: Mehrwertige Assoziationen
    (Antragsteller Middendorf, Martin ; Stadler, Peter Florian )
  - Algorithmische Methoden zur Annotation von mitochondrialen Genomen in großen Umfang
    (Antragsteller Middendorf, Martin )
  - Approximate Graph Products
    (Antragsteller Stadler, Peter Florian )
  - COIL-seq: Kartierung der dynamischen Struktur eines Cyanobakterienchromosoms
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Axmann, Ilka Maria ; Stadler, Peter Florian )
  - Funktionelle und strukturelle Konservierung ausgewählter Chromatingene in Insekten
    (Antragsteller Sass, Heinz G. )
  - Geometric representations and symmetries of graphs, maps and other discrete structures and applications in science
    (Antragsteller Stadler, Peter Florian )
  - Relative Datierung von Introninsertionsereignissen als Mittel phylogenetischer Analyse
    (Antragsteller Krauß, Veiko ; Stadler, Peter Florian )
  - Synthetische Riboswitches: Design von multi-Ligand Schaltern und neuartigen regulatorischen Prinzipien
    (Antragsteller Mörl, Mario ; Stadler, Peter Florian )
  - Ungewöhnliche RNA-Polymerasen: Reaktionsmechanismus und Substratspektrum von tRNA-Nukleotidyltransferasen
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Mörl, Mario ; Prohaska, Sonja )
Sonderforschungsbereiche
- laufende Projekte
  - Bioinformatik Unterstützung für den SFB
    (Teilprojektleiter Stadler, Peter Florian )
  - Computergestützte Modelle der Struktur, Dynamik und Evolution von GPCRs
    (Teilprojektleiter Hildebrand, Peter ; Meiler, Jens ; Stadler, Peter Florian )
  - Spezifität und Dynamik bei der Signalübertragung von peptidaktivierten GPCRs
    (Teilprojektleiter Hildebrand, Peter ; Stadler, Peter Florian )
Graduiertenkollegs
- abgeschlossene Projekte
  - GRK 446: Wissensrepräsentation
    (Sprecher Brewka, Gerhard )

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