SFB 610:
Protein-Zustände mit zellbiologischer und medizinischer Relevanz
Fachliche Zuordnung
Biologie
Förderung
Förderung von 2002 bis 2012
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5485142
Das Studium von Proteinzuständen auf molekularer Ebene ist von überaus großer Bedeutung für unser Verständnis zellbiologischer Vorgänge. Divergente Proteinzustände zeichnen sich durch verschiedene Faltungszustände, unterschiedliche posttranslationale Modifizierungen, aber auch unterschiedliche Wechselwirkungen mit anderen Biomolekülen aus. Mit Hilfe von Aptameren (bindende RNA-Moleküle), Peptiden und molekularbiologischen Techniken sollen die Proteinzustände charakterisiert, mit Hilfe der NMR-Spektroskopie, der Röntgenstrukturanalyse und des Molecular Modellings analysiert werden. Untersucht werden Zustände von Proteinen, die entweder funktionell für die Zelle relevant sind, wie z.B. Rezeptoren, Peptidligasen und Adhäsionsmoleküle, oder Zustände von Proteinen, die mit Erkrankungen in Verbindung gebracht werden. Hier werden u.a. Heterochromatinproteine (multiple Myelome), das Tau-Protein (Alzheimer) und Poly(A)-Bindungsproteine (oculopharyngeale Muskeldystrophie) bearbeitet. Des Weiteren werden interventionelle Strategien erarbeitet, die zum Ziel haben, Proteinzustände zu beeinflussen. Hierbei sollen mit Hilfe der Aptamere, der Peptide oder von Virosomen u.a. Matrixmetalloprotease-TIMP-Assoziationen und Virusprotein-Zell-Interaktionen inhibiert werden. Eine erfolgreiche Therapie von Erkrankungen, deren Ursache pathogene Proteinzustände darstellen, besitzt nur dann Aussicht auf Erfolg, wenn deren molekulare Ursachen verstanden werden. Chance zu Lösungen erwachsen nur aus einer groß angelegten Kooperation von Grundlagen- und angewandter, medizinischer Forschung.
DFG-Verfahren
Sonderforschungsbereiche
Abgeschlossene Projekte
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A01 - Bedeutung der Protein-Loop-Bereiche für die Biosynthese von Neuropeptid Y und die Interaktionen von NPY-Rezeptoren
(Teilprojektleiterin
Beck-Sickinger, Annette G.
)
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A02 - Strukturabhängigkeit des NH-Austauschs am Beispiel von Ubiquitin
(Teilprojektleiter
Berger, Stefan
)
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A03 - Proteinfoldase Parvulin 10: Funktionale Modifizierung durch native enzymatische Ligationskatalyse
(Teilprojektleiterin
Wehofsky, Nicole
)
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A04 - Entschlüsselung eines neuenartigen, durch Peptidyl-Prolyl-cis/trans-Isomerasen (PPIasen) katalyierten proteolytischen Reaktionsweges in der Zelle
(Teilprojektleiter
Fischer, Gunter S.
)
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A5 - Struktur- und Signalfunktion von armadillo-verwandten Proteinen - Analyse der Protein-Protein-Wechselwirkungen
(Teilprojektleiterin
Hatzfeld, Mechthild
)
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A6 - Phosphorylierungsabhängige Interaktion zwischen dem Transkriptionsfaktor Stat3 und Coactivatoren bei der zytokingesteuerten Genregulation
(Teilprojektleiter
Horn, Friedemann
)
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A7 - Menschliche Heterochromatinproteine - Drosophila als Modellsystem zum Studium ausgewählter menschlicher Chromatinkrankheiten
(Teilprojektleiter
Reuter, Gunter
)
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A8 - Charakterisierung des krebsrelevanten Zuotinhomologs MPP11
(Teilprojektleiterin
Rospert, Sabine Karola
)
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A09 - Die krankheitsassoziierte, poly-Alanin-hervorgerufene Fibrillenbildung und Fibrillenstruktur des nukleären poly(A)Bindungs-Protein PABPN1
(Teilprojektleiterin
Schwarz, Elisabeth
)
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A10 - Konformationsänderungen in intramolekularen Domänen von G-Proteingekoppelten Rezeptoren
(Teilprojektleiter
Schöneberg, Torsten
)
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A11 - G-Protein-gekoppelte Rezeptoren: prokaryotische Expression, in vitro-Renaturierung, Reinigung und biophysikalische Charakterisierung
(Teilprojektleiter
Rudolph, Rainer
)
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A12 - Spätzle-Spleißvarianten in den Signalwegen von Drosophila
(Teilprojektleiter
Stubbs, Milton T.
)
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A13 - Der Mechanismus der Prolylisomerase SlyD
(Teilprojektleiter
Balbach, Jochen
)
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A14 - Bestimmung der Struktur und Dynamik von rezeptorgebundenem Neuropeptid Y mittels Festkörper-NMR-Spektroskopie
(Teilprojektleiter
Huster, Ph.D., Daniel
)
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B1 - Modulation der Signaltransduktion und des Genexpressionsprofils durch Spleißvarianten des GM-CSF Rezeptors
(Teilprojektleiter
Burdach, Stefan
)
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B03 - Interaktionen zwischen Matrix Metallproteinasen, deren Fragmenten und ihren Protein-Inhibitoren (TIMPs) als therapeutische Targets
(Teilprojektleiter
Gebhardt, Rolf
)
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B4 - in vitro-Selektion Protin-Zustands-spezifischer Aptamere
(Teilprojektleiter
Hahn, Ulrich
)
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B05 - Konstruktion bifunktioneller therapeutischer Proteine auf Basis polyionischer Wechselwirkungen
(Teilprojektleiter
Lilie, Hauke
)
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B06 - Mechanismen der Neutralisation unbehüllter Viren, untersucht am Beispiel des Virus der infektiösen Bursitis (IBDV)
(Teilprojektleiter
Müller, Hermann
)
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B07 - Auswirkung von Funktionszuständen von CD44 auf die Tumorbiologie des Malignen Melanoms: ADAM10-vermitteltes Shedding von CD44
(Teilprojektleiter
Simon, Jan-Christoph
)
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B08 - Struktur allosterischer Konformationszustände eukaryotischer 6-Phosphofructokinasen
(Teilprojektleiter
Schöneberg, Torsten
;
Sträter, Norbert
)
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C01 - Funktion von p0071 bei Aufbau bzw. Aufrechterhaltung von Zellpolarität: Koordination von Cytoskelettorganisation, Vesikeltransport und -fusion
(Teilprojektleiterin
Hatzfeld, Mechthild
)
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C02 - Protein-Wechselwirkungen des Transkriptionsfaktors Stat3 bei der spezifischen zytokingesteuerten Genregulation
(Teilprojektleiter
Horn, Friedemann
)
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C03 - Multimere Enzymkomplexe und die Kontrolle von Chromatinzuständen
(Teilprojektleiter
Reuter, Gunter
)
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C04 - Die asymmetrische Dimethylierung von Arginin-Seitenketten im nukleären Poly(A)-Bindungsprotein (PABPN1)
(Teilprojektleiter
Wahle, Elmar
)
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C05 - Funktionelle Domänen und Regulation der onkofötalen IMP-Proteine
(Teilprojektleiter
Hüttelmaier, Stefan
)
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MGK - Integriertes Graduiertenkolleg
(Teilprojektleiter
Schöneberg, Torsten
;
Stubbs, Milton T.
)
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N01 - Analysis of the structure and aggregation properties of natural and disease-related variants of the Alzheimer's Aß peptide
(Teilprojektleiter
Fändrich, Marcus
)
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T01 - Bioelektronische Hochdurchsatztestung von Wirkstoffkandidaten in Zellkultur und 3D- (in vitro) Gewebemodellen für chronische Neuropathien
(Teilprojektleiterin
Robitzki, Andrea A.
)
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Z03 - Molekülmodellierung
(Teilprojektleiter
Günther, Robert
;
Hofmann, Hans-Jörg
)
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Z04 - Zentrale Aufgaben des Sonderforschungsbereichs
(Teilprojektleiterin
Beck-Sickinger, Annette G.
)
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Z05 - Funktionsanalysen von Proteinzuständen in Echtzeit mittels Zell- und Gewebebasierter Biosensoren
(Teilprojektleiterin
Robitzki, Andrea A.
)