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SFB 1286: Quantitative Synaptologie
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Medizin
Biologie
Physik
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Förderung
Förderung seit 2017
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Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 317475864
Synapsen sind die zentralen Informations-Prozessoren im Gehirn. Ihre Funktion, Effizienz und Plastizität sind die Schlüsseldeterminanten aller Gehirnfunktionen. Umgekehrt bedeutet dies, dass eine anormale Synapsenfunktion die Ursache vieler neurologischer und psychiatrischer Störungen ist. Unser Ziel ist es letztendlich, eine funktionelle virtuelle Synapse in silico zu generieren, die sowohl das prä- als auch das postsynaptische Kompartiment umfasst. Unsere Gesamtstrategie, die eng an unserem ursprünglichen Antrag aus dem Jahr 2017 orientiert ist, war die folgende. In der ersten Förderperiode sammelten wir umfangreiche molekulare, strukturelle und funktionelle Daten zu einer prototypischen, gemittelten Modellsynapse, während wir gerade erst mit der computergestützten Arbeit begannen. In der zweiten Förderperiode verfeinerten wir unsere Datensätze durch weitere Laborarbeiten und bauten gleichzeitig die computergestützten Aspekte unserer Arbeit deutlich aus, indem wir mehrere zusätzliche Projekte der Computational Neuroscience in den SFB integrierten. Dies bildete die Grundlage für die dritte Förderperiode, in der wir uns noch stärker auf In-silico-Modellierung stützen werden, um die SFB-Daten zusammen mit Daten aus der Literatur zu einem strukturellen und funktionellen Modell einer prototypischen, gemittelten Synapse zu kombinieren. In der dritten Förderperiode werden wir auf all diesen Elementen aufbauen und unser Göttinger Synapsenmodell entwickeln, das es dem Forschungsfeld ermöglicht, offene Fragen zu synaptischer Funktion und Dysfunktion zu beantworten. Dieses Modell basiert auf definierten experimentellen und rechnerischen Arbeiten aus den vorherigen Förderperioden, sowie auf Ergebnissen der dritten Förderperiode und beinhaltet ein kürzlich vom SFB veröffentlichtes Konzept: Dem synaptischen Vesikelcluster (SVC) kommt eine Schlüsselrolle bei der Regulierung der Präsynapse zu und beeinflusst gleichzeitig die postsynaptische Funktion. Durch die Kombination unserer grundlagenwissenschaftlichen Ansätze mit pathologiebasierten Analysen und einem alterungs- und umsatzbasierten Fokus, erwarten wir ein Modell, das wesentliche Hinweise darauf liefert, wie pharmakologische Interventionen zur Linderung oder Vorbeugung von Synapsendysfunktion eingesetzt werden sollten. Es zeigt auf, welche Prozesse am besten angegangen werden sollten und wie diese angegangen werden können. Wir gehen zudem davon aus, dass unsere Arbeit im Kontext der Konnektomik von großer Bedeutung sein wird, da unser Modell letztlich dazu beitragen wird, funktionelle Merkmale von Synapsen in einem gegebenen strukturellen Konnektom vorherzusagen und so den funktionellen Informationsgehalt des Konnektoms grundlegend zu erhöhen. Schließlich erwarten wir, dass die identifizierten funktionellen Merkmale neue Impulse für die Entwicklung neuroinspirierter Algorithmen und energieeffizienter Hardwarearchitekturen geben werden, die die künstliche Intelligenz voranbringen.
DFG-Verfahren
Sonderforschungsbereiche
Laufende Projekte
- A02 - Bestimmung der Struktur synaptischer Organellen durch Röntgenbeugungs- und Bildgebungsverfahren (Teilprojektleiter Salditt, Tim )
- A03 - Molekulare Analyse wichtiger Punkte der synaptischen Aktivität (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Rizzoli, Ph.D., Silvio-Olivier ; Simeth-Crespi, Nadja Anita )
- A04 - Untersuchung der ultrastrukturellen Auswirkungen von Aktivität und Alterung auf das Vesikelrecycling und den Proteinumsatz (Teilprojektleiterin Wichmann, Carolin )
- A05 - Mitochondriale Heterogenität in Synapsen (Teilprojektleiter Jakobs, Stefan )
- A06 - Proteostaseprozesse an synaptischen Mitochondrien (Teilprojektleiter Rehling, Peter )
- A07 - Oberflächenmobilität von Glutamatrezeptoren (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter D' Este, Elisa ; Hell, Stefan W. )
- A09 - Syntax posttranslationaler Proteinmodifikationen durch UBLs in der präsynaptischen Funktion (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Brose, Nils ; Tirard, Marilyn )
- A11 - Regulierung der synaptischen funktionellen Heterogenität und Diversität (Teilprojektleiterin Lipstein-Thoms, Ph.D., Noa )
- A12 - Nanometrische Architektur des synaptischen Zytoskeletts (Teilprojektleiter Fernandez Busnadiego, Ruben )
- B02 - Der synaptische Vesikelcluster als Regulator der präsynaptischen Biomechanik (Teilprojektleiterinnen Köster, Sarah ; Reshetniak, Sofiia )
- B04 - In vitro Rekonstitution von inhibitorischen GABAergen Postsynapsen (Teilprojektleiterin Steinem, Claudia )
- B05 - Quantitative molekulare Physiologie aktiver Zonen in Calyx-Synapsen (Teilprojektleiter Moser, Tobias )
- B06 - Die Rolle von RNA in Synapsenphysiologie und Neurodegeneration (Teilprojektleiter Fischer, André ; Outeiro, Tiago Fleming )
- B08 - Proteinaggregation: Marker und Treiber synaptischer Dysfunktion (Teilprojektleiter Outeiro, Tiago Fleming )
- B10 - Nanoskalige Dynamik und Regulation von Synapsin-Kondensaten (Teilprojektleiter Milovanovic, Dragomir )
- B11 - Gating und Expression langfristiger synaptischer Plastizität als Wechselspiel zwischen parallelen Übertragungsstellen und Astrozytensignalisierung (Teilprojektleiter Schlüter, Oliver M. )
- B12 - Superauflösende Analyse des Neuron-Glia-Zusammenspiels an dreigliedrigen Synapsen (Teilprojektleiter Nägerl, Ph.D., Urs Valentin )
- C01 - Der Einfluss molekularer Heterogenitäten auf flüssige Phasen in der Synapse (Teilprojektleiter Tetzlaff, Christian )
- C02 - Nanoskalige geometrische Fokussierung synaptischer Kalziumdomänen (Teilprojektleiter Wolf, Fred )
- C03 - Langzeitdynamik der Postsynapse im Verhältnis zu ihrer Umgebung (Teilprojektleiter Fauth, Michael )
- C06 - Grobkörnige Simulation über die Rolle der lokalen Millieu bei der präsynaptischen Freisetzung: von der Fusion zur Fission (Teilprojektleiter Müller, Marcus )
- C08 - Experimentelle und theoretische Analyse der Funktion einzelner aktiver Zonen (Teilprojektleiter Moser, Tobias )
- C09 - Verknüpfung der Dynamik in der Präsynapse über mehrere Zeitskalen hinweg mit neuronaler Berechnung (Teilprojektleiterin Priesemann, Viola )
- C10 - Innovative Deep-Learning-Ansätze ermöglichen quantitative Analysen synaptischer Bildgebungsdatensätze (Teilprojektleiter Pape, Constantin )
- C11 - Energieoptimierung als Organisationsprinzip der Proteindynamik an der Synapse (Teilprojektleiterin Tchumatchenko, Tatjana )
- C12 - Eine multiskalige Analyse des synaptischen Umsatzes zur Modellierung der dynamischen Veränderungen, die die synaptische Funktion prägen (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Fornasiero, Ph.D., Eugenio ; Senk, Johanna )
- Z01 - Verwaltungsprojekt (Teilprojektleiter Rizzoli, Ph.D., Silvio-Olivier )
- Z02 - Integration von Computermodellen und experimentellen Daten (Teilprojektleiter Bonn, Stefan ; Tetzlaff, Christian )
- Z04 - Quantitative Visualisierung und Analyse synaptischer Proteine mit Hilfe von Nanobodies (Teilprojektleiter Opazo, Felipe )
Abgeschlossene Projekte
- A01 - Die Ultrastruktur der Synapse in Aktion (Teilprojektleiter Cooper, Ph.D., Benjamin )
- A08 - Die Rolle post-translational modifizierter Proteine in der synaptischen Übertragung (Teilprojektleiter Jahn, Reinhard ; Urlaub, Henning )
- A10 - Betrachtung von Protein–Protein Interaktionen an der Synapse durch quantitatives Protein Cross-linking (Teilprojektleiter Urlaub, Henning )
- B01 - Der Verteilung struktureller Lipide in synaptischen Membranen (Teilprojektleiterin Phan, Thi Ngoc Nhu )
- B03 - Kartierung der Protein- und Lipidorganisation in der neuronalen Plasmamembran durch Rapid-Rupture-Rasterkraftmikroskopie (Teilprojektleiter Janshoff, Andreas )
- B09 - Cytoskelettale Veränderungen tragen zu synapto-axonalen Fehlfunktionen in Morbus Parkinson bei (Teilprojektleiter Lingor, Paul )
- C05 - Die Synapse als ein komplexes physikalisches Milieu (Teilprojektleiter Klumpp, Stefan )
- Z03 - Unkomplizierte multispektrale, superauflösende Bildgebung durch zehnfache Expansionsmikroskopie (Teilprojektleiter Rizzoli, Ph.D., Silvio-Olivier )
Antragstellende Institution
Georg-August-Universität Göttingen
Beteiligte Hochschule
Universitätsklinikum Bonn
Institut für Experimentelle Epileptologie und Kognitionsforschung; Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf
Institut für Experimentelle Epileptologie und Kognitionsforschung; Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf
Beteiligte Institution
Forschungszentrum Jülich GmbH
Institute for Advanced Simulation (IAS); Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP)
im Forschungsverbund Berlin e.V.; Max-Planck-Institut für Dynamik und Selbstorganisation (MPIDS); Max-Planck-Institut für Multidisziplinäre Naturwissenschaften; Max-Planck-Institut für medizinische Forschung; Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE)
c/o Charité - Universitätsmedizin Berlin; Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE)
Standort Göttingen
Institute for Advanced Simulation (IAS); Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP)
im Forschungsverbund Berlin e.V.; Max-Planck-Institut für Dynamik und Selbstorganisation (MPIDS); Max-Planck-Institut für Multidisziplinäre Naturwissenschaften; Max-Planck-Institut für medizinische Forschung; Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE)
c/o Charité - Universitätsmedizin Berlin; Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE)
Standort Göttingen
