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Institution

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Universität zu Köln
Department für Biologie
Institut für Genetik

Adresse Zülpicher Straße 47a
50674 Köln
Deutschland

GERiT Diese Institution in GERiT

50674 Köln

Projekte

Schwerpunktprogramme
- laufende Projekte
  - Koordinierung von zellulärer Proteostase und Proteinimport in den mitochondrialen Intermembranraum
    (Antragsteller Hoppe, Thorsten ; Riemer, Jan )
  - Rolle, Ursprung und Entwicklung von MFN2 bei der Proteinaggregation und der mitochondrialen Importkapazität
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Escobar-Henriques, Mafalda ; Hofmann, Kay )
- abgeschlossene Projekte
  - Adaptive Evolution von Genfamilien des Immunsystems: Ursprung, Diversifizierung und Diversität der NLR Gene im Zebrafisch
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Leptin, Ph.D., Maria ; Wiehe, Thomas )
  - Biogenese des Proteasoms in Saccharomyces cerevisiae
    (Antragsteller Dohmen, Jürgen )
  - Die Molekulare Grundlage von Phänotypischer Plastizität und Genetischer Assimilation in schnell evolvierender Linien Ostafrikanischer Buntbarsche
    (Antragsteller Meyer, Axel )
  - Entschlüsselung des menschlichen nonsense-vermittelten mRNA-Abbaus (NMD)
    (Antragsteller Dieterich, Christoph ; Gehring, Niels H. )
  - FGF-receptor dependent cell migration in Drosophila
    (Antragstellerin Leptin, Ph.D., Maria )
  - Kombinatorische und probabilistische Eigenschaften der Topologie von genealogischen Baeumen und Anwendung in der Populationsgenetik
    (Antragsteller Wiehe, Thomas )
  - Koordinationsfonds
    (Antragsteller Gehring, Niels H. )
  - SPP 1935: Deciphering the mRNP code: RNA-bound determinants of post-transcriptional gene regulation
    (Sprecher Gehring, Niels H. )
  - SUMO-SIM interactions and their role in substrate recognition and autoregulation of SUMO-dependent ubiquitin ligases
    (Antragsteller Dohmen, Jürgen )
Sachbeihilfen
- laufende Projekte
  - Bestimmung der Rolle von GTP-Cyclohydrolase 1/Dihydrobiopterin bei kältebedingter Langlebigkeit
    (Antragsteller Vilchez, David )
  - Der Ursprung der Deubiquitinasen - Ein evolutionärer Ansatz zur Identifizierung und zum Verständnis neuer Ubiquitin- und UBL-Proteasen.
    (Antragsteller Hofmann, Kay )
  - Die Rolle der EPS8-vermittelten RAC-Aktivierung bei der krankheitsbedingten Proteinaggregation
    (Antragsteller Vilchez, David )
  - Entschlüsselung der Rolle der U5 snRNA-Isoformen als Treiber der U5 snRNP-Diversität und der Spleißosom-Plastizität während Entwicklung und Homöostase.
    (Antragstellerin Uhlirova, Mirka )
  - G-Protein-gekoppelte Rezeptoren: Evolution von ligandengesteuerter Zugangskontrolle zur Regulierung der Bindungsaffinität
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Baumann, Arnd ; Korsching, Sigrun ; Sharma, Kanika )
  - Strukturelle und biochemische Studien zur Aufklärung des Biogenesewegs von 20S-Proteasomen
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Dohmen, Jürgen ; Wendler, Petra )
- abgeschlossene Projekte
  - Definierung der repressiven, epigenetischen Regulationsmechanismen durch das E2 Ubiquitin- konjugierendes Enzym UBE2K und deren Auswirkung auf die Schicksalsentscheidung von Zellen und auf den Alterungsprozess eines Organismus
    (Antragsteller Vilchez, David )
  - Die genetische Aufschlüsselung der Koordinationsmechanismen von Immunität und Stoffwechsel
    (Antragstellerin Uhlirova, Mirka )
  - Die Rolle der VHL/HIF-Achse in zellulärer Stressresistenz
    (Antragsteller Müller, Roman-Ulrich )
  - DNA-Doppelstrangbruch-Reparatur mittels nichthomologer End-Verknüpfung und die Entstehung von Chromosomenaberrationen
    (Antragstellerin Pfeiffer, Petra )
  - Einfluss des Zelltyps auf mechanische Eigenschaften der Zelle: Koordination der Zellbewegungen während der Gastrulation bei Drosophila
    (Antragstellerin Leptin, Ph.D., Maria )
  - Entschlüsselung der Funktionen menschlicher "Exon-Junction Complexes"
    (Antragsteller Dieterich, Christoph ; Gehring, Niels H. )
  - Genetische Steuerung der Gastrulationsbewegungen im Drosophila Embryo
    (Antragstellerin Leptin, Ph.D., Maria )
  - Gezielte Umgestaltung und Funktionsänderung von Lac Repressor aus E.coli.
    (Antragsteller Müller-Hill, Benno )
  - Identification of mRNAs with polar distributions in complex cells and their functional characterization
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Leptin, Ph.D., Maria ; Roth, Siegfried )
  - Klonierung und Charakterisierung eines neuen Gens für das Usher-Syndrom Typ 2
    (Antragsteller Benzing, Thomas )
  - Lokale Anpassung von Daphnia an Protease Inhibitoren in Cyanobakterien
    (Antragsteller von Elert, Ph.D., Eric )
  - Mechanisms of polyamine-dependent control of ornithine decarboxylase and its antizyme
    (Antragsteller Dohmen, Jürgen )
  - Molekulare Mechanismen der Mechanotransduktion während der Tumorprogression
    (Antragstellerin Uhlirova, Mirka )
  - Multiubiquitylation Pathways Involved in Muscle Assembly
    (Antragsteller Hoppe, Thorsten )
  - Regulation der Genomstabilität durch Chromatin-assoziierten Proteinabbau
    (Antragsteller Hoppe, Thorsten )
  - Regulation der Mitochondrialen Fusion durch Ubiquitilierung von Mitofusine
    (Antragstellerin Escobar-Henriques, Mafalda )
  - Ubiquitin - mediated proteolysis of misfolded cytosolic proteins
    (Antragsteller Dohmen, Jürgen )
  - Untersuchung der molekularen Prinzipien der UPF1-abhaengigen mRNA Substraterkennung und -abbau
    (Antragsteller Gehring, Niels H. ; Landthaler, Markus )
  - Zelluläre Grundlagen der Reaktion des Tracheensystems bei Drosophila auf Veränderungen im Sauerstoffbedarf
    (Antragstellerin Leptin, Ph.D., Maria )
Forschungsgruppen
- laufende Projekte
  - FOR 2743: Zelluläre Schutzmechanismen gegen mechanischen Stress
    (Sprecher Höhfeld, Jörg )
  - FOR 5504: Physiologische Ursachen und Konsequenzen der Genominstabilität
    (Sprecher Schumacher, Björn )
  - Koordinierung von DNA-Schadens Reparatur und Alterung durch Ubiquitin-Signalwege
    (Antragsteller Hoppe, Thorsten )
  - Stress-induzierte Myosin-Faltungs- und Anordnungsmechanismen
    (Antragsteller Hoppe, Thorsten )
- abgeschlossene Projekte
  - Analysis of cytoplasmic functions of the exon junction complex
    (Antragsteller Gehring, Niels H. )
  - Coordination of morphogenetic actions across the entire organism
    (Antragstellerin Leptin, Ph.D., Maria )
  - FOR 885: Neuronal Protein Turnover
    (Sprecher Glatzel, Markus )
  - RP1: Identification of ubiquitin-dependent pathways involved in neuron-specific protein degradation
    (Antragsteller Hoppe, Thorsten )
  - RP7: Investigation of novel mechanisms in degradation of aggregated neuroserpin
    (Antragsteller Glatzel, Markus ; Hoppe, Thorsten )
Heisenberg-Stipendien
- abgeschlossene Projekte
  - Regulation und Qualitätskontrolle humaner mRNPs
    (Antragsteller Gehring, Niels H. )
  - The evolution of natural variation and molecular innovations in social insects
    (Antragsteller Hasselmann, Martin )
Heisenberg-Professuren
- abgeschlossene Projekte
  - Mechanismen der Genexpression in Eukaryoten
    (Antragsteller Gehring, Niels H. )
Heisenberg-Förderung
- abgeschlossene Projekte
  - Mechanismen der Genexpression in Eukaryoten
    (Antragsteller Gehring, Niels H. )
Emmy Noether-Nachwuchsgruppen
- laufende Projekte
  - ADP-Ribosylierung am Kernporenkomplex
    (Antragstellerin Leidecker, Orsolya )
Sonderforschungsbereiche
- laufende Projekte
  - Auswirkungen des nonsense-mediated mRNA decay auf die Fidelität der Genexpression
    (Teilprojektleiter Gehring, Niels H. )
  - Die Bestimmung des Zusammenspiels zwischen RNA- und Protein-Toxizität bei C9orf72-assoziierter Amyotropher Lateralsklerose (ALS)
    (Teilprojektleiter Vilchez, David )
  - Die Entwicklung des regulierten nekrotischen Zelltods
    (Teilprojektleiter Hofmann, Kay )
  - Forschungsdatenmanagement, Analyse und Bioinformatikunterstützung
    (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Hofmann, Kay ; von Karstedt, Silvia ; Wesner, Stefan )
  - Integriertes Graduiertenkolleg "mito-RTG"
    (Teilprojektleiter Dohmen, Jürgen ; Riemer, Jan )
  - Koordination von mit dem endoplasmatischen Retikulum assoziierten Fidelitäts-Mechanismen
    (Teilprojektleiter Hoppe, Thorsten )
  - Transkriptomik in der Wüste: Bewertung der genetischen Grundlagen der Anpassung an Trockenheit bei Wüstenbewohnern
    (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Bechteler, Julia ; Quandt, Dietmar ; Wiehe, Thomas )
  - Ubiquitin-abhängige Koordination der mitochondrialen-zytoplasmatischen Qualitätskontrolle
    (Teilprojektleiter Hoppe, Thorsten )
- abgeschlossene Projekte
  - An der FGF-Signalübertragung und Dynamik von Adhärenzverbindungen beteiligte Phosphotyrosinadapter
    (Teilprojektleiterin Leptin, Ph.D., Maria )
  - Charakterisierung eines evolutionär alten Zelltod-Moduls
    (Teilprojektleiter Hofmann, Kay ; Pasparakis, Manolis )
  - Die genetische und zellbiologische Kontrolle der Gastrulation bei Drosophila
    (Teilprojektleiterin Leptin, Ph.D., Maria )
  - Evolutionäre Innovationen - eine Fallstudie über Chromatin-Insulator-proteine
    (Teilprojektleiter Wiehe, Thomas )
  - Evolution der Erde und des Lebens auf kurzen Zeitskalen
    (Teilprojektleiter Wiehe, Thomas )
  - Evolution von Protisten in extrem wasserlimitierten Gebieten
    (Teilprojektleiter Arndt, Hartmut ; Wiehe, Thomas )
  - Genetische Interaktionen zwischen Tumoren und ihrem Mikromilieu
    (Teilprojektleiterin Uhlirova, Mirka )
  - Mehrlagige Kontrolle des SUMO-modifizierten Zustandes von Proteinen
    (Teilprojektleiter Dohmen, Jürgen )
  - Neuronaler Proteinabbau
    (Teilprojektleiter Hoppe, Thorsten )
  - Rolle der SUMO-abhängigen Ubiquitylierung in der Kontrolle mitochondrialer Teilungen
    (Teilprojektleiter Dohmen, Jürgen )
  - Substrate recruitment and ubiquitylation by E3 ligase complexes
    (Teilprojektleiter Hoppe, Thorsten )
  - The role of UPF1 phosphorylation during nonsense-mediated mRNA decay
    (Teilprojektleiter Gehring, Niels H. )
Deutsch-Israelische-Projektkooperationen
- abgeschlossene Projekte
  - Die Ubiquitinierung als proteolytisches Signal - Neuartige Wege der Modifikation und Erkennung
    (Antragsteller Glickman, Michael H. ; Hoppe, Thorsten )
Klinische Forschungsgruppen
- abgeschlossene Projekte
  - KFO 286: Defekte in der zellulären DNA Damage Response als Ziel für neue, personalisierte CLL-Therapien
    (Sprecher Hallek, Michael )
  - Ubiquitin abhängige Regulation von DNA Damage-induzierter Apoptose und Bedeutung für die Chemoresistenz refraktärer CLL
    (Antragsteller Hoppe, Thorsten ; Kashkar, Hamid )
Forschungsgroßgeräte
- abgeschlossene Projekte
  - Durchflusszytometer für große und komplexe Probentypen
Transregios
- laufende Projekte
  - Evolutionäre Signaturen in der Variation der Genkopienzahl bei Brassicaceae
    (Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Rose, Laura ; Wiehe, Thomas )
Graduiertenkollegs
- laufende Projekte
  - GRK 2550: Dynamische Regulation zellulärer Proteinlokalisationen
    (Sprecher Riemer, Jan )
- abgeschlossene Projekte
  - GRK 296: Genetik zellulärer Systeme
    (Sprecherin Leptin, Ph.D., Maria )
Exzellenzcluster (ExStra)
- laufende Projekte
  - EXC 2030: CECAD - Exzellent in Alternsforschung
    (Sprecherinnen / Sprecher Benzing, Thomas ; Hoppe, Thorsten ; Niessen, Carien )
Exzellenzcluster
- abgeschlossene Projekte
  - EXC 229: Zelluläre Stressantworten bei Alters-assoziierten Erkrankungen
    (Sprecher Brüning, Jens Claus )

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